260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0405 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  100 
 
 		 402 aa  825    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2978  prophage LambdaSo, site-specific recombinase phage integrase family protein  38.12 
 
 		 399 aa  278  9e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2610  integrase family protein  35.93 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3889  phage integrase, putative  37.69 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000353876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1581  hypothetical protein  77.48 
 
 		 168 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638214  normal  0.178566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4126  phage integrase family protein  36.92 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.727989  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  34.41 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  34.63 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3261  phage integrase  29.6 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0304734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2555  phage integrase family protein  30.87 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3363  phage integrase family protein  30.87 
 
 		 422 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.267116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1655  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0191595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3254  phage integrase family protein  30.6 
 
 		 422 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1973  phage integrase family protein  30.6 
 
 		 422 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2028  integrase family protein  30.6 
 
 		 422 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0404622  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1978  integrase family protein  30.6 
 
 		 422 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000635719  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3487  integrase family protein  30.6 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0968357  unclonable  0.00000880604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3391  integrase family protein  30.6 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1861  phage integrase family protein  30.6 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00488759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0775  integrase family protein  28.87 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0745  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0772  integrase family protein  28.87 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.045428  normal  0.308658 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3610  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842919  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  22.67 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  22.67 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.75 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  22.13 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  25.21 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  24.93 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  26.89 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  24.48 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  25.14 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  23.51 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  25.37 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  22.44 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  24.59 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  25.27 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  23.29 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  23.12 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  24.33 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  22.22 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.3 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  23.56 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  24.35 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  23.35 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  24.16 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  24.34 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  22.8 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  23.44 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  23.44 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  22.5 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  23.28 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  23.44 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  22.31 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  23.29 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  22.16 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  21.61 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  24.4 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  24.78 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  22.16 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1213  ferredoxin, 4Fe-4S  30.88 
 
 		 288 aa  62  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  22 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1277  putative phage integrase  27.69 
 
 		 454 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  28.06 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  24.63 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  24.65 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  20.51 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  21.84 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  20.84 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  26.26 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  24.73 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  22.43 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  24.16 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  23.53 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  21.35 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  21.57 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  23.74 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  21.53 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  20.95 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  23.85 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  24.78 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  22.92 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  22.64 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  22.92 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  24.93 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  22.22 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  22.39 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  23.12 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>