More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5058 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  99.52 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  98.09 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 216 aa  279  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  63.06 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 214 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  28.95 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 309 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  28.82 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 770 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1799  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1477  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  34.09 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1658  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.166061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1859  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1797  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125509  normal  0.0456013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  39.19 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2967  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699652  normal  0.0717993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  27.69 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1188  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 242 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  41.56 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
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NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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