More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1732 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  95.6 
 
 
546 aa  1087    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  96.15 
 
 
546 aa  1097    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  57.45 
 
 
549 aa  648    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  90.84 
 
 
546 aa  1045    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  73.44 
 
 
543 aa  848    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  100 
 
 
546 aa  1123    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  54.75 
 
 
547 aa  597  1e-169  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  50.92 
 
 
557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  49.09 
 
 
557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  50.18 
 
 
557 aa  559  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  48.08 
 
 
557 aa  536  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  48.1 
 
 
559 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  41.87 
 
 
617 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  40.11 
 
 
604 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  42.58 
 
 
610 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  39.03 
 
 
622 aa  395  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
620 aa  395  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  37.94 
 
 
618 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  40.87 
 
 
512 aa  386  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  46.3 
 
 
513 aa  372  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  36.49 
 
 
547 aa  286  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  34.55 
 
 
682 aa  272  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
545 aa  270  5e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  35.87 
 
 
749 aa  269  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  34.7 
 
 
628 aa  264  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  34.76 
 
 
791 aa  264  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  37.47 
 
 
609 aa  263  6e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  32.57 
 
 
654 aa  263  6e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  38.78 
 
 
847 aa  263  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  37.44 
 
 
797 aa  261  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  38.86 
 
 
831 aa  259  6e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
671 aa  259  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  33.68 
 
 
542 aa  258  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  34.04 
 
 
510 aa  258  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  38.76 
 
 
1335 aa  253  6e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  37.82 
 
 
1255 aa  253  9.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  34.49 
 
 
558 aa  252  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
556 aa  251  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  38.08 
 
 
1319 aa  250  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  36.57 
 
 
549 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  33.05 
 
 
583 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  36.47 
 
 
640 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  40.19 
 
 
991 aa  244  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  35.32 
 
 
549 aa  243  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  35.13 
 
 
491 aa  242  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
519 aa  242  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  36.91 
 
 
692 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  30.46 
 
 
722 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  36.84 
 
 
551 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  36.63 
 
 
492 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  35.31 
 
 
591 aa  229  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.39 
 
 
489 aa  228  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  34.32 
 
 
770 aa  226  9e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  36.34 
 
 
572 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  36.04 
 
 
577 aa  223  9e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  42.49 
 
 
612 aa  217  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  36.48 
 
 
311 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.96 
 
 
473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  27.62 
 
 
476 aa  167  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  30.03 
 
 
408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  31.18 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  32.72 
 
 
473 aa  164  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  29.86 
 
 
548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  30.73 
 
 
552 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  30.99 
 
 
452 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  28.5 
 
 
445 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  29.07 
 
 
515 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  30.81 
 
 
440 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  29.19 
 
 
552 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  30.68 
 
 
485 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  30.68 
 
 
482 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  30 
 
 
553 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  30 
 
 
553 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  30 
 
 
553 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  30 
 
 
553 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  29.91 
 
 
482 aa  160  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
521 aa  159  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  31.31 
 
 
479 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  30.2 
 
 
480 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.66 
 
 
483 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  30.93 
 
 
498 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  31.83 
 
 
500 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  31.88 
 
 
544 aa  159  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  31.64 
 
 
450 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  30.12 
 
 
463 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  31.02 
 
 
432 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  36.25 
 
 
412 aa  158  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  30.79 
 
 
433 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  30.17 
 
 
482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  29.14 
 
 
485 aa  157  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  29.63 
 
 
438 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  29.53 
 
 
464 aa  157  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  30.23 
 
 
484 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.15 
 
 
453 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  30.51 
 
 
488 aa  156  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  29.17 
 
 
444 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  30.29 
 
 
478 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  30.29 
 
 
451 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  29.19 
 
 
463 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>