More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0781 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 757 aa  1545    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  41.69 
 
 		 730 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 731 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 688 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  25.45 
 
 		 691 aa  139  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 715 aa  134  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 728 aa  126  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  22.59 
 
 		 700 aa  124  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  22.59 
 
 		 700 aa  124  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 700 aa  124  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 700 aa  124  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 700 aa  124  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 700 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  22.47 
 
 		 721 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  24 
 
 		 712 aa  122  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 700 aa  122  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  22.33 
 
 		 706 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.33 
 
 		 706 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  22.19 
 
 		 706 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 700 aa  120  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  22.33 
 
 		 706 aa  121  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 680 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 700 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 694 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 706 aa  119  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 720 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.39 
 
 		 726 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 709 aa  116  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 705 aa  114  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  23.5 
 
 		 689 aa  105  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 735 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  22.36 
 
 		 681 aa  101  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 628 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 711 aa  99.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 777 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 777 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 777 aa  98.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 778 aa  96.3  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 720 aa  95.5  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 675 aa  94.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  23.85 
 
 		 687 aa  94  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  19.48 
 
 		 701 aa  93.6  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 801 aa  92.8  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 701 aa  92.4  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 		 723 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 678 aa  90.1  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 709 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 705 aa  89.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 718 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 697 aa  89  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 792 aa  88.6  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  30.18 
 
 		 638 aa  87.4  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 723 aa  87.4  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  22.11 
 
 		 788 aa  87.4  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  21.61 
 
 		 747 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 822 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 774 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 781 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 723 aa  86.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  21.95 
 
 		 696 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 732 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 741 aa  85.9  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 750 aa  85.5  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  22.88 
 
 		 708 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 724 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  21.73 
 
 		 756 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  21.44 
 
 		 705 aa  84.7  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  22.94 
 
 		 796 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 		 746 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  21.73 
 
 		 756 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 747 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  21.73 
 
 		 756 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  21.74 
 
 		 696 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  23.7 
 
 		 623 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 747 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  22.86 
 
 		 822 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  23.27 
 
 		 690 aa  84  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 720 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  21.73 
 
 		 756 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  21.74 
 
 		 696 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 724 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 796 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  21.63 
 
 		 756 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  22.38 
 
 		 705 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  22.33 
 
 		 796 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 770 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 723 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  22.12 
 
 		 710 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  23.05 
 
 		 690 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  21.33 
 
 		 675 aa  82.4  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  21.94 
 
 		 820 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  22.16 
 
 		 757 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 706 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  23.31 
 
 		 807 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 732 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 728 aa  81.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 747 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 708 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 757 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>