More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2182 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  407  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 188 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  52.27 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  52.27 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.04 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  41.73 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  51.76 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  38.69 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  41.23 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  41.96 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  50.68 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  37.78 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  33.68 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  46.51 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  44.95 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  51.14 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  36.24 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  48.24 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  47.13 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3935  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00534901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  42.98 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  50.77 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  56.67 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  49.23 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>