More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0506 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  63.16 
 
 		 192 aa  228  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  63.87 
 
 		 190 aa  227  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  62.77 
 
 		 193 aa  219  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  53.4 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  51.31 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  51.06 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  41.58 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  40.31 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  38.86 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  41.92 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  40.21 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  41.12 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  39.9 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  40.93 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  40.21 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  40.76 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  38.5 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  41.08 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 169 aa  104  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 195 aa  104  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  41.05 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  39.89 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  40.64 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  38.3 
 
 		 192 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  41.04 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  35.53 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  40.11 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  40.61 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  39.78 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  33.51 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.65 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  30.23 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  24.24 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  25.3 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  26.99 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  24.86 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  28.73 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  24.86 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  24.86 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  26.22 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  25.7 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.07 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  30.59 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  26.14 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  30.63 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  25.14 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  24.29 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  24.29 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  24.29 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  24.29 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  30.36 
 
 		 175 aa  51.2  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 227 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  28.72 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  22.75 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.77 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  27.85 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  31.11 
 
 		 269 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  25.27 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  24.85 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>