More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4812 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
1755 aa  3397    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  44.71 
 
 
1264 aa  759    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  43.42 
 
 
1987 aa  572  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 
623 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  36.23 
 
 
570 aa  238  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 
374 aa  215  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  32.68 
 
 
637 aa  213  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.05 
 
 
440 aa  211  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  32.53 
 
 
544 aa  203  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  31.85 
 
 
543 aa  201  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.53 
 
 
542 aa  198  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  45.97 
 
 
478 aa  191  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  42.01 
 
 
458 aa  181  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  41.73 
 
 
727 aa  180  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  43.58 
 
 
490 aa  172  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  37.18 
 
 
1793 aa  168  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  42.86 
 
 
320 aa  167  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  32.52 
 
 
2074 aa  165  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  30.24 
 
 
498 aa  165  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.03 
 
 
456 aa  164  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  48.72 
 
 
540 aa  162  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  48.15 
 
 
506 aa  161  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  39.93 
 
 
487 aa  158  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.5 
 
 
447 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.96 
 
 
319 aa  149  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  39.2 
 
 
420 aa  147  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  41.92 
 
 
386 aa  148  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  29.98 
 
 
510 aa  145  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  41.54 
 
 
386 aa  145  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.92 
 
 
412 aa  144  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.52 
 
 
427 aa  139  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  37.9 
 
 
402 aa  126  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.81 
 
 
294 aa  127  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  37.11 
 
 
417 aa  125  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.86 
 
 
429 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
428 aa  123  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  26.37 
 
 
671 aa  117  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  29.2 
 
 
322 aa  106  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  40.62 
 
 
351 aa  105  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
239 aa  106  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.02 
 
 
240 aa  105  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  40.12 
 
 
264 aa  102  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  39.75 
 
 
350 aa  102  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  39.75 
 
 
350 aa  102  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40.37 
 
 
344 aa  101  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  31.7 
 
 
656 aa  101  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40.37 
 
 
344 aa  101  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 
401 aa  101  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  41.03 
 
 
344 aa  101  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.75 
 
 
345 aa  100  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  40.83 
 
 
694 aa  100  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  45.69 
 
 
193 aa  99.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 
215 aa  99.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  39.51 
 
 
239 aa  99.4  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 
244 aa  99  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  38.51 
 
 
344 aa  97.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
671 aa  98.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.91 
 
 
707 aa  98.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  41.32 
 
 
525 aa  98.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.51 
 
 
344 aa  97.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  40 
 
 
380 aa  97.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  37.26 
 
 
722 aa  97.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  45.1 
 
 
422 aa  95.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  31.84 
 
 
314 aa  95.9  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2434  OmpA/MotB domain protein  43.08 
 
 
507 aa  95.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  42.37 
 
 
412 aa  95.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  43.44 
 
 
263 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.12 
 
 
237 aa  94.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  43.95 
 
 
722 aa  94.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  48.89 
 
 
792 aa  94.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  37.89 
 
 
344 aa  93.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  29.91 
 
 
381 aa  93.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 
445 aa  92.8  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 
459 aa  93.2  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  35.03 
 
 
440 aa  92.8  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  45.54 
 
 
240 aa  92.8  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  42.62 
 
 
263 aa  92  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 
210 aa  92  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  42.62 
 
 
263 aa  92  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  43.44 
 
 
264 aa  92  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 
223 aa  91.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 
630 aa  91.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  43.86 
 
 
243 aa  91.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  38.06 
 
 
890 aa  91.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 
586 aa  91.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  42.75 
 
 
221 aa  90.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 
362 aa  90.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 
344 aa  90.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 
432 aa  90.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  40.67 
 
 
403 aa  90.1  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  42.99 
 
 
533 aa  89.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  40.4 
 
 
333 aa  89.7  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 
658 aa  89.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  37.14 
 
 
640 aa  90.1  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  43.86 
 
 
220 aa  89.4  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.11 
 
 
209 aa  89.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  40.98 
 
 
262 aa  89.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.98 
 
 
261 aa  89.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  37.39 
 
 
626 aa  89.4  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  40.37 
 
 
398 aa  89  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>