More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0850 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0850  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
379 aa  770    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138704  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1379  secretion protein HlyD family protein  42.74 
 
 
374 aa  297  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 
373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  28.35 
 
 
324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  28.91 
 
 
394 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  27.98 
 
 
373 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  27.54 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  26.36 
 
 
375 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  26.36 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  26.02 
 
 
423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  24.54 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  26.77 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  23.56 
 
 
393 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  25.96 
 
 
443 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  25.41 
 
 
370 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  28.25 
 
 
368 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  28.19 
 
 
349 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  30.86 
 
 
358 aa  106  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  27.79 
 
 
331 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  24.13 
 
 
366 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  27.89 
 
 
356 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  26.83 
 
 
374 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  25.61 
 
 
368 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  24.12 
 
 
375 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  25.81 
 
 
400 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  24.6 
 
 
334 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  24.41 
 
 
350 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  22.1 
 
 
369 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  24.93 
 
 
352 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  24.61 
 
 
352 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  24.93 
 
 
352 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  25.63 
 
 
349 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  25.94 
 
 
332 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  24.4 
 
 
366 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  26.97 
 
 
351 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  24.93 
 
 
352 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  26.97 
 
 
351 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  29.11 
 
 
301 aa  99  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  24.4 
 
 
354 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  25.53 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  26.81 
 
 
456 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  39.06 
 
 
328 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  25.97 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  28.62 
 
 
393 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 
367 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  24.26 
 
 
347 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  24.66 
 
 
390 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  25.75 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  27.69 
 
 
344 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 
367 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  23.03 
 
 
381 aa  96.3  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  25.34 
 
 
410 aa  96.3  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  25.13 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  24.15 
 
 
352 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  26.98 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  30.13 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  24.26 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0099  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.46 
 
 
220 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  27.73 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  37.21 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  26.42 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  24.33 
 
 
358 aa  94.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 
383 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  26.99 
 
 
383 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  26.65 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  26.03 
 
 
348 aa  94  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  26.68 
 
 
413 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  25.71 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  26.52 
 
 
402 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  26.07 
 
 
352 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  25.15 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  26.35 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  31.69 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  25.07 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  20.28 
 
 
470 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 
342 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3489  putative secretion protein  22.77 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0544122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  23.12 
 
 
355 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  25.81 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  20.28 
 
 
475 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  20.28 
 
 
475 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  24.86 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003356  multidrug resistance efflux pump  31 
 
 
271 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000276837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  24.86 
 
 
401 aa  90.1  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  33.85 
 
 
411 aa  89.7  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  23.56 
 
 
372 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  23.85 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  26.04 
 
 
333 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  24.93 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  23.61 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.73 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  23.41 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.54 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  25.13 
 
 
360 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 
479 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  24.17 
 
 
394 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  25.75 
 
 
401 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>