More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0618 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
392 aa  773    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  42.51 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 
373 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  39.43 
 
 
324 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  36.34 
 
 
394 aa  209  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  38.04 
 
 
393 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  32.05 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  33.03 
 
 
351 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  33.23 
 
 
351 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  32.05 
 
 
352 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  32.05 
 
 
352 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  32.92 
 
 
352 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  32.72 
 
 
351 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 
356 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  32.82 
 
 
351 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  37.24 
 
 
402 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  34.25 
 
 
383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 
364 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  35.71 
 
 
372 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  33.92 
 
 
341 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  34.64 
 
 
421 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  35.03 
 
 
348 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  32.9 
 
 
390 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
413 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  30.67 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  32.74 
 
 
358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 
375 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  28.69 
 
 
368 aa  146  5e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  30.83 
 
 
406 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  30.23 
 
 
391 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  32.22 
 
 
349 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  31.64 
 
 
366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  34.28 
 
 
380 aa  145  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  31.34 
 
 
366 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  35.09 
 
 
401 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  31.98 
 
 
394 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  31.84 
 
 
400 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  30.11 
 
 
404 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  33.06 
 
 
383 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  34.06 
 
 
354 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 
352 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  30.99 
 
 
387 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  34.69 
 
 
401 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  33.17 
 
 
393 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  30.99 
 
 
387 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  33.43 
 
 
349 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  33.43 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  33.82 
 
 
355 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  34.77 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  34.37 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  31.65 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  33.82 
 
 
344 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 
351 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  28.44 
 
 
413 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  35.19 
 
 
381 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  32.93 
 
 
456 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  33.65 
 
 
385 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  36.14 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  33.06 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  27.2 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  35.88 
 
 
397 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  29.11 
 
 
368 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  30.7 
 
 
347 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  30.73 
 
 
463 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  29.46 
 
 
349 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  36 
 
 
377 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  32.45 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  31.51 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  34.41 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  30.03 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  32.78 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  34.66 
 
 
397 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  31.05 
 
 
467 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  33.93 
 
 
411 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  29.94 
 
 
355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  31.59 
 
 
365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  31.06 
 
 
355 aa  133  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  33.73 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  31.47 
 
 
405 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  32.31 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  30.49 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  32.92 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  34.69 
 
 
378 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  32.86 
 
 
374 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  32.56 
 
 
360 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  31.99 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  34.04 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  26.55 
 
 
334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  30.72 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  30.11 
 
 
423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  33.8 
 
 
422 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  31.23 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  34.82 
 
 
405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  24.87 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  33.52 
 
 
387 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  31.38 
 
 
368 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  31.36 
 
 
331 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  34.5 
 
 
392 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>