More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0064 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 346 aa  692    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  68.59 
 
 		 331 aa  434  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  66.36 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  63.11 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  54.18 
 
 		 332 aa  348  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  40.66 
 
 		 366 aa  249  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  41.23 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  39.83 
 
 		 359 aa  242  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  40.06 
 
 		 374 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  38.51 
 
 		 366 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  38.07 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  38.06 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  37.58 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  40.41 
 
 		 347 aa  225  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  40.66 
 
 		 368 aa  223  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 		 368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  37.35 
 
 		 375 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  46.58 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  46.23 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1574  secretion protein HlyD  45.89 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  36.61 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  36.78 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  38.01 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  36.76 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.76 
 
 		 355 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  37.47 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.12 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  34.45 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35.12 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  35.14 
 
 		 401 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.42 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  36.97 
 
 		 349 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 		 400 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  37.85 
 
 		 348 aa  188  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  38.23 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  37.16 
 
 		 349 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  36.88 
 
 		 390 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  35.88 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  37.5 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6361  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  37.38 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  36.78 
 
 		 395 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1467  secretion protein HlyD  41.64 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0027674  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  34.82 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  37.32 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  37.32 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  37.32 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7028  secretion protein HlyD family protein  40.61 
 
 		 342 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146297  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.5 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.16 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  37.16 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  32.86 
 
 		 411 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 401 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 413 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  37.09 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 383 aa  176  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  35.48 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 352 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  34.59 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  34.7 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.45 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 352 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  39.04 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  32.5 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  31.96 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  33.05 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  36.76 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  37.16 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  33.53 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  35.45 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  35.86 
 
 		 394 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  38.39 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  34.71 
 
 		 456 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  33.72 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  36.04 
 
 		 400 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 411 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  33.53 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 411 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 411 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  37.12 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  33.24 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  34.11 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  33.53 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  33.53 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  33.53 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  33.53 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>