More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3353 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  100 
 
 
872 aa  1775    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  40.94 
 
 
1212 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 
1450 aa  266  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  40.1 
 
 
1038 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 
760 aa  262  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 
608 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  38.99 
 
 
3145 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  39.16 
 
 
688 aa  258  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.95 
 
 
689 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
1827 aa  253  8.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  37.47 
 
 
523 aa  253  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 
653 aa  249  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  36.57 
 
 
653 aa  249  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 
542 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
747 aa  244  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
955 aa  239  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  39.27 
 
 
412 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 
578 aa  238  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  37.6 
 
 
767 aa  238  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 
740 aa  237  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  39.15 
 
 
556 aa  237  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
601 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  37.37 
 
 
648 aa  234  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
662 aa  234  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 
602 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 
574 aa  233  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  35.07 
 
 
703 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 
607 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  35.41 
 
 
1077 aa  231  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  41.96 
 
 
387 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  38.11 
 
 
472 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
935 aa  229  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 
637 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 
520 aa  225  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  34.7 
 
 
1764 aa  225  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  36.5 
 
 
1677 aa  225  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.85 
 
 
1034 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35.22 
 
 
620 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.77 
 
 
1005 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 
611 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.99 
 
 
603 aa  220  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  38.2 
 
 
473 aa  220  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  36.78 
 
 
577 aa  220  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.73 
 
 
620 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 
780 aa  218  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
595 aa  218  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  39.7 
 
 
389 aa  218  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 
681 aa  218  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 
747 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 
505 aa  213  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
615 aa  213  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.36 
 
 
457 aa  213  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  38.39 
 
 
360 aa  213  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  37.22 
 
 
1451 aa  212  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  37.22 
 
 
1454 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  37.47 
 
 
615 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 
636 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  34.72 
 
 
1073 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 
923 aa  207  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.28 
 
 
714 aa  207  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
583 aa  204  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  34.11 
 
 
546 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  33.41 
 
 
503 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 
592 aa  201  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
545 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.14 
 
 
454 aa  200  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 
545 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 
571 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 
558 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 
550 aa  198  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
496 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  34.29 
 
 
600 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 
545 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 
593 aa  197  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  33.33 
 
 
630 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
529 aa  193  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
714 aa  193  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
639 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 
573 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
636 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.62 
 
 
604 aa  190  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 
588 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.52 
 
 
626 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
607 aa  190  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.74 
 
 
626 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
559 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 
614 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 
614 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.74 
 
 
614 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.74 
 
 
614 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
527 aa  189  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
612 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
545 aa  187  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  31.81 
 
 
484 aa  187  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 
646 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
637 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
649 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
649 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 
626 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>