84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3077 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  57.7 
 
 		 557 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1156    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  53.08 
 
 		 518 aa  543  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.13 
 
 		 1432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1177 aa  121  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.54 
 
 		 995 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1299 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1154 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1147 aa  114  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1612 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  25.79 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1426 aa  110  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22 
 
 		 1076 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1036 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  28.11 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.2 
 
 		 974 aa  99.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  25.46 
 
 		 629 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.84 
 
 		 416 aa  97.8  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1209 aa  91.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  24.47 
 
 		 493 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  25.08 
 
 		 1132 aa  85.5  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  23.33 
 
 		 1244 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1338 aa  82  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  22.61 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  24.11 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  23.53 
 
 		 1257 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1120 aa  79.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  28.84 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  29.2 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  27.05 
 
 		 573 aa  73.6  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  20.39 
 
 		 836 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  23.76 
 
 		 1239 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  22.25 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  24.21 
 
 		 1189 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  27.92 
 
 		 694 aa  65.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  22.77 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  20.58 
 
 		 1159 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1195 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  24.44 
 
 		 595 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.43 
 
 		 1058 aa  63.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  30.69 
 
 		 604 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1184 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0523  hypothetical protein  58 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  21.51 
 
 		 1252 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  21.33 
 
 		 1020 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1231 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  27.68 
 
 		 1256 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  23.68 
 
 		 746 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1210 aa  54.7  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  34.41 
 
 		 950 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  22.49 
 
 		 1222 aa  52  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1282 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  23.44 
 
 		 523 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  19.52 
 
 		 533 aa  51.6  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  26.98 
 
 		 389 aa  51.2  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  24.35 
 
 		 792 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1233 aa  50.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  34.15 
 
 		 684 aa  50.8  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  29.55 
 
 		 423 aa  50.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  23.14 
 
 		 404 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  23.41 
 
 		 569 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  26.46 
 
 		 405 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  32.94 
 
 		 495 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1231 aa  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1209 aa  47.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  24.14 
 
 		 1693 aa  47  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  24.07 
 
 		 908 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  23.77 
 
 		 1186 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  23.02 
 
 		 568 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1182 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  26.77 
 
 		 1417 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  21.2 
 
 		 524 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  29.58 
 
 		 926 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.17 
 
 		 1041 aa  44.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  25.62 
 
 		 584 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  34.07 
 
 		 816 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  22.67 
 
 		 1059 aa  44.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 1516 aa  43.9  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  26.34 
 
 		 552 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1324 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1241 aa  43.9  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1016 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1178 aa  43.5  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  24.59 
 
 		 1170 aa  43.5  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>