More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1007 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  100 
 
 		 453 aa  896    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  64.4 
 
 		 452 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  55.53 
 
 		 459 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  56.06 
 
 		 459 aa  480  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  51.42 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  45.84 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  42.37 
 
 		 471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  42.59 
 
 		 476 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  42.79 
 
 		 500 aa  300  4e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  42.01 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  42.5 
 
 		 476 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.18 
 
 		 457 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  48.3 
 
 		 474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.42 
 
 		 386 aa  283  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.21 
 
 		 476 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  45.03 
 
 		 476 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  46.91 
 
 		 369 aa  279  9e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  44.59 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.01 
 
 		 464 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  40 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  35.9 
 
 		 473 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  38.17 
 
 		 503 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  38.21 
 
 		 503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  39.25 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  42.94 
 
 		 478 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  45.48 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.71 
 
 		 384 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  35.73 
 
 		 478 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.83 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  48.33 
 
 		 379 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  38.27 
 
 		 489 aa  272  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  37.74 
 
 		 474 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  43.16 
 
 		 481 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  36.9 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  47.53 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  37.26 
 
 		 474 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  48.49 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  46.82 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  35.99 
 
 		 473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  45.95 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.51 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  48.69 
 
 		 473 aa  267  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  35.01 
 
 		 464 aa  267  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.03 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.27 
 
 		 485 aa  267  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.77 
 
 		 475 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  40.21 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  45.78 
 
 		 508 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  42.6 
 
 		 497 aa  266  8e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.35 
 
 		 464 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  36.75 
 
 		 498 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  37.44 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  36.21 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  40.41 
 
 		 503 aa  264  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  39.48 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  44.71 
 
 		 415 aa  263  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  41.23 
 
 		 479 aa  263  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  44.35 
 
 		 411 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  38.22 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.35 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  36.5 
 
 		 474 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.02 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  35.76 
 
 		 479 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  42.68 
 
 		 492 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  36.71 
 
 		 485 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  36.6 
 
 		 469 aa  259  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  38.28 
 
 		 535 aa  259  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  42.77 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  39.61 
 
 		 487 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  40.26 
 
 		 516 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  38.84 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.38 
 
 		 386 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  45.72 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  36.06 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  38.72 
 
 		 477 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.18 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.48 
 
 		 412 aa  257  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  36.56 
 
 		 502 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  36.47 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  36.47 
 
 		 502 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  36.47 
 
 		 485 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  36.47 
 
 		 502 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  36.47 
 
 		 502 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  36.56 
 
 		 502 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  37.83 
 
 		 482 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.3 
 
 		 477 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  42.73 
 
 		 408 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  42.11 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  38.56 
 
 		 492 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  35.33 
 
 		 473 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  38.63 
 
 		 479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  38.24 
 
 		 481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  36.51 
 
 		 528 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  41.96 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  36.3 
 
 		 499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  34.94 
 
 		 501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  42.98 
 
 		 501 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.47 
 
 		 483 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  36.49 
 
 		 514 aa  254  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.89 
 
 		 483 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>