More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1746 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 1021 aa  2085    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  36.48 
 
 		 511 aa  266  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  33.03 
 
 		 510 aa  258  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  35.27 
 
 		 484 aa  241  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  32.73 
 
 		 524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  32.53 
 
 		 462 aa  205  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  29.41 
 
 		 620 aa  200  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.56 
 
 		 1891 aa  197  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  30.37 
 
 		 610 aa  190  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  33.4 
 
 		 526 aa  189  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  28.33 
 
 		 623 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  32.36 
 
 		 2638 aa  185  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  30.38 
 
 		 528 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 528 aa  183  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  32.36 
 
 		 752 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  29.78 
 
 		 490 aa  182  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.14 
 
 		 2068 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  30.06 
 
 		 703 aa  181  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  28.5 
 
 		 604 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  27.88 
 
 		 885 aa  177  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  29.53 
 
 		 593 aa  175  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  30.75 
 
 		 838 aa  173  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.59 
 
 		 1855 aa  171  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  28.52 
 
 		 630 aa  168  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  29.04 
 
 		 533 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  28 
 
 		 599 aa  167  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  31.63 
 
 		 600 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  28.19 
 
 		 649 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 		 836 aa  166  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  31.34 
 
 		 572 aa  163  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  32.03 
 
 		 561 aa  162  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  30.19 
 
 		 571 aa  162  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.14 
 
 		 1975 aa  159  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  31.16 
 
 		 642 aa  158  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  27.34 
 
 		 742 aa  157  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  30.67 
 
 		 654 aa  157  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  28 
 
 		 644 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  27.45 
 
 		 623 aa  155  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  28.14 
 
 		 690 aa  155  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.59 
 
 		 814 aa  155  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  29.05 
 
 		 686 aa  154  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  28.11 
 
 		 686 aa  153  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  31.23 
 
 		 641 aa  151  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  30.22 
 
 		 687 aa  151  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  28.86 
 
 		 631 aa  150  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  29.1 
 
 		 576 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  28.09 
 
 		 609 aa  148  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  29.2 
 
 		 639 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  29.13 
 
 		 559 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  25.71 
 
 		 687 aa  146  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  28.16 
 
 		 1005 aa  146  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  25 
 
 		 566 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  28.7 
 
 		 564 aa  145  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  25.89 
 
 		 687 aa  145  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  25.89 
 
 		 687 aa  145  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  27.89 
 
 		 686 aa  144  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  29.03 
 
 		 925 aa  144  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  27.89 
 
 		 665 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  27.69 
 
 		 683 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  28.39 
 
 		 665 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  26.35 
 
 		 688 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 		 619 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  28.1 
 
 		 778 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  28.09 
 
 		 765 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  26.96 
 
 		 631 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  30.56 
 
 		 553 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  27.82 
 
 		 774 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  30.08 
 
 		 606 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  30.08 
 
 		 606 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  25.3 
 
 		 582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  25.21 
 
 		 762 aa  133  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.04 
 
 		 588 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  28.23 
 
 		 620 aa  131  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 		 739 aa  131  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  28.06 
 
 		 532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 		 521 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  26.41 
 
 		 694 aa  127  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  26.71 
 
 		 574 aa  127  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  27.33 
 
 		 477 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  27.61 
 
 		 586 aa  125  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  25.3 
 
 		 676 aa  125  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  26.53 
 
 		 786 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  25.35 
 
 		 767 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  47.55 
 
 		 614 aa  121  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  29.7 
 
 		 635 aa  121  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  26.64 
 
 		 552 aa  118  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  36.71 
 
 		 609 aa  118  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  26.88 
 
 		 587 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  28.29 
 
 		 617 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  24.7 
 
 		 589 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  37.98 
 
 		 653 aa  114  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.45 
 
 		 499 aa  114  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  46.32 
 
 		 1942 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  23.99 
 
 		 676 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  27.52 
 
 		 486 aa  112  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.85 
 
 		 610 aa  112  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  24.53 
 
 		 1401 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  25.47 
 
 		 1401 aa  112  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  26.08 
 
 		 584 aa  111  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  38.1 
 
 		 622 aa  111  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>