268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0880 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  624  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  42.72 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  40.8 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  33.87 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  32.51 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  33.01 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  33.01 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  32.37 
 
 		 320 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  34.08 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  34.39 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  32.38 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  33.76 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  33.76 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  30.35 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  31.67 
 
 		 322 aa  149  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  31.61 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  32.92 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  34.48 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.99 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  32.62 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  33.08 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  32.49 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  32.49 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  32.17 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  29.9 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  31.92 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.9 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  32.18 
 
 		 372 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  32.72 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  31.83 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  31.94 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.65 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.07 
 
 		 314 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  31.33 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  32.19 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  31.13 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  32.13 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.98 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30.58 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.16 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  29.74 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  31.34 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  29.41 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  29.47 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  29.69 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25.71 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.88 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  28.39 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  24.61 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.27 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  26.75 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  34.19 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.85 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.27 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  29.29 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.27 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  26.5 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  26.28 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  29.71 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  26.88 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.08 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.08 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  25.89 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.08 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  29.91 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  22.02 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  26.93 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  28.19 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  26.65 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  25.31 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.81 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  29.78 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  23.7 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  26.99 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  26.99 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  23.7 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  22.52 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  22.93 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  25.67 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.39 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  29.48 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  24.06 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>