More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3361 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
373 aa  751    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  77.36 
 
 
373 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  37.17 
 
 
394 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  39.17 
 
 
392 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 
324 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 
460 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 
460 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  32.97 
 
 
470 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  32.97 
 
 
475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  32.97 
 
 
475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  32.42 
 
 
468 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
414 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  34.13 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  31.78 
 
 
372 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  31.4 
 
 
393 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  32.01 
 
 
393 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  31.96 
 
 
370 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  28.45 
 
 
347 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  35.01 
 
 
390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  29.84 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  29.95 
 
 
374 aa  146  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  32.43 
 
 
397 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  30.11 
 
 
355 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  30.11 
 
 
344 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  26.33 
 
 
359 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  30.51 
 
 
422 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  31.74 
 
 
364 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  32.01 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  30.62 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  31.56 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 
358 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  31.18 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  33.05 
 
 
401 aa  140  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  32.52 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  32.51 
 
 
402 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  32.49 
 
 
366 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  31.62 
 
 
371 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  31.13 
 
 
402 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  33.95 
 
 
333 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.93 
 
 
375 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  30.4 
 
 
348 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  27.17 
 
 
347 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  32.29 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  28.01 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  29.76 
 
 
390 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  30.45 
 
 
383 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  31.17 
 
 
394 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  32.95 
 
 
413 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  28.86 
 
 
352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  30.92 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  29.94 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  28.08 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  32.82 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  32.35 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  28.49 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  32.45 
 
 
378 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 
421 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  30.7 
 
 
385 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  31.3 
 
 
351 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  27.98 
 
 
368 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  32.12 
 
 
344 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  31.02 
 
 
351 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  30.52 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  31.4 
 
 
348 aa  132  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  30.48 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  25.27 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  31.95 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  30.48 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  31.42 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  29.2 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  31.12 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  29.2 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  30.51 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  31.09 
 
 
395 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 
352 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  28.33 
 
 
411 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1379  secretion protein HlyD family protein  25.87 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  27.67 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  30.92 
 
 
351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  28.57 
 
 
349 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  30.99 
 
 
349 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  27.11 
 
 
423 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  27.56 
 
 
375 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  31.96 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  31.56 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  27.95 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  29.97 
 
 
401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  28.61 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  29.75 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  28 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  29.14 
 
 
387 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  31.65 
 
 
374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  29.01 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  30.6 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  29.63 
 
 
443 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>