105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2221 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  100 
 
 		 1669 aa  3419    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  80.32 
 
 		 1669 aa  2765    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  41.42 
 
 		 1726 aa  1254    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  42.16 
 
 		 1706 aa  1244    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  36.52 
 
 		 1703 aa  854    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  36.68 
 
 		 1700 aa  877    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  36.93 
 
 		 1516 aa  830    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  37.76 
 
 		 1575 aa  786    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  41.02 
 
 		 1925 aa  678    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  32.02 
 
 		 2570 aa  744    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  40.06 
 
 		 1649 aa  1027    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  75.59 
 
 		 1642 aa  2548    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  33.62 
 
 		 1932 aa  841    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1748 aa  880    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  36.34 
 
 		 1702 aa  878    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  37.11 
 
 		 1417 aa  730    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  36.86 
 
 		 1697 aa  868    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  35.14 
 
 		 1693 aa  853    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  36.13 
 
 		 1606 aa  813    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  39.53 
 
 		 2077 aa  1117    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  35.93 
 
 		 1697 aa  870    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  35.84 
 
 		 1701 aa  867    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  33.14 
 
 		 1934 aa  824    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  39.01 
 
 		 2098 aa  994    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  34.48 
 
 		 1722 aa  685    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 1594 aa  636  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 1674 aa  626  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  28.29 
 
 		 2117 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  33.77 
 
 		 2274 aa  613  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  35.11 
 
 		 1211 aa  595  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  39.06 
 
 		 2005 aa  494  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  33.74 
 
 		 1956 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  36.81 
 
 		 976 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  32.11 
 
 		 763 aa  290  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  32.74 
 
 		 761 aa  280  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  30.73 
 
 		 766 aa  229  4e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  35.83 
 
 		 470 aa  186  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  33.06 
 
 		 526 aa  154  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 577 aa  152  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  23.9 
 
 		 1379 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  35.16 
 
 		 284 aa  100  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 		 678 aa  97.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  26.47 
 
 		 1328 aa  96.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  27.82 
 
 		 442 aa  90.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  26.32 
 
 		 339 aa  73.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  27.27 
 
 		 341 aa  73.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  26.92 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  31.43 
 
 		 254 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1276  hypothetical protein  25.47 
 
 		 315 aa  61.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0854607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  29.49 
 
 		 669 aa  58.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  27.1 
 
 		 468 aa  57  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  27.59 
 
 		 595 aa  54.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1768  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  54.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  31.19 
 
 		 969 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1803  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  54.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  27.81 
 
 		 922 aa  53.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  30.43 
 
 		 466 aa  52.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  29.29 
 
 		 889 aa  52.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  26.42 
 
 		 604 aa  52.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  32.74 
 
 		 924 aa  52.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  27.78 
 
 		 910 aa  51.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  32.95 
 
 		 894 aa  52  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  32.79 
 
 		 953 aa  50.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  37.66 
 
 		 958 aa  50.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  24.1 
 
 		 541 aa  50.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  37.66 
 
 		 958 aa  50.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  34.18 
 
 		 933 aa  49.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 		 1002 aa  48.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  32.63 
 
 		 928 aa  48.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  29.08 
 
 		 919 aa  48.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  32.89 
 
 		 573 aa  48.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3080  helicase related protein  30.66 
 
 		 1786 aa  48.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  29.03 
 
 		 1256 aa  48.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5012  helicase domain protein  33.67 
 
 		 1055 aa  48.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  29.03 
 
 		 949 aa  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  22.22 
 
 		 572 aa  48.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  27.56 
 
 		 1065 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  27.56 
 
 		 1065 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  33.62 
 
 		 872 aa  47.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  34.44 
 
 		 1147 aa  48.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  26.24 
 
 		 707 aa  47.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  38.71 
 
 		 1049 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  32.18 
 
 		 900 aa  47  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  23.5 
 
 		 490 aa  46.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  20.97 
 
 		 493 aa  46.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  34.57 
 
 		 957 aa  46.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  34.94 
 
 		 950 aa  46.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.63 
 
 		 941 aa  46.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.63 
 
 		 941 aa  46.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  25.93 
 
 		 1086 aa  46.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  29.46 
 
 		 748 aa  46.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  26.72 
 
 		 952 aa  45.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  23.67 
 
 		 522 aa  45.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  30.09 
 
 		 946 aa  45.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 		 876 aa  45.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  32.53 
 
 		 986 aa  45.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.67 
 
 		 971 aa  45.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  23.84 
 
 		 479 aa  45.8  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.87 
 
 		 1169 aa  45.8  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.56 
 
 		 694 aa  45.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>