More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1662 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  100 
 
 
820 aa  1691    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2071  hypothetical protein  36.69 
 
 
512 aa  216  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2061  hypothetical protein  36.09 
 
 
512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4702  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.13 
 
 
464 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.781083  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1382  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.1 
 
 
510 aa  205  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4554  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.24 
 
 
331 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 
994 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  29.05 
 
 
659 aa  187  7e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
1168 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
1267 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.15 
 
 
640 aa  180  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.82 
 
 
791 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.16 
 
 
769 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2518  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.03 
 
 
751 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00063624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
1363 aa  174  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.83 
 
 
1333 aa  171  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.23 
 
 
505 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
904 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  49.71 
 
 
1301 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
1291 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.29 
 
 
1358 aa  165  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.16 
 
 
1959 aa  165  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0064  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.81 
 
 
803 aa  164  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59154e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  48.33 
 
 
591 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3550  diguanylate cyclase  47.22 
 
 
559 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953301  normal  0.354246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  43.89 
 
 
1079 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0081  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.85 
 
 
804 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
839 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
3706 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1679  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.17 
 
 
1050 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251418  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  31.22 
 
 
1000 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2192  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 
359 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0311386  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3902  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.71 
 
 
990 aa  157  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  39.6 
 
 
487 aa  157  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  31.8 
 
 
1428 aa  157  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.29 
 
 
469 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.48 
 
 
1078 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.07 
 
 
419 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.27 
 
 
1369 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 
906 aa  154  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.04 
 
 
1258 aa  153  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.89 
 
 
1423 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0309  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
827 aa  153  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0510078  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1297  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  27.75 
 
 
926 aa  152  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
1362 aa  151  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  45.6 
 
 
753 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2758  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.86 
 
 
698 aa  151  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.69 
 
 
1158 aa  151  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1262 aa  151  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
577 aa  151  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4063  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.32 
 
 
1183 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1361  diguanylate cyclase  32.83 
 
 
731 aa  151  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.32 
 
 
1183 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543508  normal  0.654737 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  36.12 
 
 
1258 aa  150  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03712  hypothetical protein  28.44 
 
 
1178 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433519  normal  0.713314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.32 
 
 
424 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1678  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.22 
 
 
612 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.95 
 
 
714 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.86 
 
 
710 aa  148  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0872705  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.33 
 
 
624 aa  149  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  31.52 
 
 
638 aa  148  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  30 
 
 
900 aa  148  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1318  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.83 
 
 
720 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.14823 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1504  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.96 
 
 
944 aa  147  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.628866  normal  0.0653987 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  38.93 
 
 
830 aa  146  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2281  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.85 
 
 
450 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.67 
 
 
1094 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4331  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.24 
 
 
921 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.0586924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
512 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  30.5 
 
 
340 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3390  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.23 
 
 
867 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.81451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 
510 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  43.09 
 
 
736 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2637  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.25 
 
 
678 aa  146  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.5465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3258  sensory box protein  25.22 
 
 
1206 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  28.88 
 
 
425 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1557 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
481 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.29 
 
 
958 aa  145  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  42.13 
 
 
556 aa  145  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.09 
 
 
962 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3546  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.11 
 
 
438 aa  145  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0176083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48220  cyclic di-GMP signal transduction protein  34.62 
 
 
344 aa  144  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.590583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  26.98 
 
 
418 aa  144  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  43.94 
 
 
689 aa  144  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0162  diguanylate cyclase  39.91 
 
 
614 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
1075 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
1637 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  29.16 
 
 
420 aa  144  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2315  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.13 
 
 
458 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6871  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.47 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2305  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.29 
 
 
935 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0882428  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1934  hypothetical protein  32.19 
 
 
634 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2588  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.54 
 
 
710 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0652312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3863  diguanylate cyclase  43.3 
 
 
426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  33.43 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3750  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.3 
 
 
718 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2409  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 
729 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.798311  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4044  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.8 
 
 
702 aa  142  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246164  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.7 
 
 
855 aa  142  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.045119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>