More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0027 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  38.03 
 
 
1193 aa  863  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  100 
 
 
1213 aa  2506  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  37.16 
 
 
1190 aa  761  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  42.16 
 
 
1188 aa  968  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  39.83 
 
 
1196 aa  832  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  35.93 
 
 
1208 aa  788  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  37.28 
 
 
1221 aa  833  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  32.67 
 
 
1209 aa  620  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31.74 
 
 
1247 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.48 
 
 
1188 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  30.79 
 
 
1411 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  35.98 
 
 
1474 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  36.64 
 
 
1443 aa  460  1e-128  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.99 
 
 
1557 aa  456  1e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  38.65 
 
 
696 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  2.05441e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  35.33 
 
 
1363 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  34.13 
 
 
1523 aa  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  36.93 
 
 
1652 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  36.05 
 
 
947 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  37.59 
 
 
1236 aa  407  1e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  35.85 
 
 
1163 aa  400  1e-110  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  38.04 
 
 
1789 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.75 
 
 
1686 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  37.61 
 
 
1364 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  34.51 
 
 
1454 aa  382  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  33.55 
 
 
1868 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  36.29 
 
 
1510 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  35.9 
 
 
1553 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.73 
 
 
1481 aa  369  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
1831 aa  356  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.77 
 
 
1711 aa  349  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  32.5 
 
 
1552 aa  343  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.63 
 
 
1609 aa  337  8e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  36.33 
 
 
566 aa  337  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.07 
 
 
919 aa  331  5e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  34.16 
 
 
1176 aa  331  5e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  34.96 
 
 
1217 aa  327  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.83 
 
 
1760 aa  325  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  36.01 
 
 
1656 aa  323  1e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  32.05 
 
 
1367 aa  323  2e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.14 
 
 
1901 aa  322  2e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  35.93 
 
 
1357 aa  320  7e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.73 
 
 
1262 aa  319  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.93 
 
 
1807 aa  317  9e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.52 
 
 
930 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.33 
 
 
1229 aa  306  1e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.98 
 
 
1416 aa  306  2e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  32.25 
 
 
1177 aa  301  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.62 
 
 
1599 aa  301  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.12 
 
 
1211 aa  301  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  3.73823e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  32.25 
 
 
1348 aa  300  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  32.79 
 
 
1661 aa  299  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  33.05 
 
 
1714 aa  298  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  31 
 
 
1242 aa  296  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.49 
 
 
1607 aa  293  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.97 
 
 
1583 aa  293  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.6 
 
 
1598 aa  287  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.76 
 
 
1626 aa  284  6e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.3 
 
 
1617 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.65 
 
 
1547 aa  280  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  32.27 
 
 
1280 aa  279  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  30.27 
 
 
728 aa  276  1e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.24 
 
 
1684 aa  274  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  28.88 
 
 
1161 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  28.88 
 
 
1161 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.03 
 
 
924 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  30.9 
 
 
1209 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.27 
 
 
1623 aa  267  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  28.97 
 
 
1766 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.2 
 
 
1823 aa  261  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  28.13 
 
 
1164 aa  261  5e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  30.11 
 
 
505 aa  257  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  28.95 
 
 
1304 aa  256  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.97 
 
 
1344 aa  251  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  33.26 
 
 
471 aa  248  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  27.68 
 
 
608 aa  248  7e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.12 
 
 
1267 aa  247  1e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  29.67 
 
 
1041 aa  246  2e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.18 
 
 
1330 aa  245  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 
1190 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  27.77 
 
 
1264 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  27.77 
 
 
1264 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.66 
 
 
1214 aa  238  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35295e-06 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  27.96 
 
 
1484 aa  238  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  37.9 
 
 
344 aa  235  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  37.32 
 
 
344 aa  235  4e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  28.93 
 
 
1016 aa  234  8e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.55 
 
 
1205 aa  234  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.72 
 
 
677 aa  233  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  28.93 
 
 
1016 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  36.86 
 
 
1599 aa  233  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  28.82 
 
 
1373 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17344e-06 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.48 
 
 
1039 aa  232  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.72 
 
 
1856 aa  229  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.69 
 
 
1399 aa  228  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.32 
 
 
1240 aa  228  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.88 
 
 
740 aa  226  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.02 
 
 
676 aa  223  1e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  33.59 
 
 
1878 aa  222  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.05 
 
 
1491 aa  221  9e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>