More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5241 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  45.88 
 
 		 1168 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  40.11 
 
 		 1220 aa  708    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  52.17 
 
 		 1197 aa  672    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  37.88 
 
 		 1148 aa  658    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  40.3 
 
 		 1157 aa  693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  38.05 
 
 		 1179 aa  699    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1774  transcription-repair coupling factor  36.96 
 
 		 1122 aa  639    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  48.28 
 
 		 1155 aa  645    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  46.69 
 
 		 1169 aa  679    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1864  transcription-repair coupling factor  38.85 
 
 		 1147 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0555269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1642  transcription-repair coupling factor protein  38.94 
 
 		 1157 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  39.66 
 
 		 1176 aa  749    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  38.37 
 
 		 1165 aa  749    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  36.62 
 
 		 1165 aa  647    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  37.27 
 
 		 1164 aa  643    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  45.88 
 
 		 1168 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  40.19 
 
 		 1176 aa  754    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  39.61 
 
 		 1178 aa  752    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  39.29 
 
 		 1176 aa  751    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1689  transcription-repair coupling factor  38.73 
 
 		 1141 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281852 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  36.44 
 
 		 1153 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  36.35 
 
 		 1153 aa  659    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0884  transcription-repair coupling factor  42.26 
 
 		 1216 aa  761    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  36.81 
 
 		 1168 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  40.88 
 
 		 1210 aa  739    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1201  transcription-repair coupling factor  38.04 
 
 		 1154 aa  653    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.656597  normal  0.0999319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  35.95 
 
 		 1157 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  49.93 
 
 		 1218 aa  682    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  39.5 
 
 		 1176 aa  741    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  41.1 
 
 		 1234 aa  735    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1709  transcription-repair coupling factor  37.56 
 
 		 1137 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517079  normal  0.0571023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  37.69 
 
 		 1160 aa  659    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  46.91 
 
 		 1161 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1257  transcription-repair coupling factor  39.03 
 
 		 1147 aa  665    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.230651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  51.62 
 
 		 1182 aa  676    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  37.62 
 
 		 1148 aa  664    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0031  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1195 aa  644    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  37.09 
 
 		 1196 aa  732    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  40.14 
 
 		 1158 aa  731    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0777  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  37.94 
 
 		 1194 aa  699    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  35.9 
 
 		 1159 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  40.19 
 
 		 1176 aa  754    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.64 
 
 		 1179 aa  733    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  39.27 
 
 		 1153 aa  689    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0639  transcription-repair coupling factor  37.98 
 
 		 1156 aa  638    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  49.43 
 
 		 1183 aa  681    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  39.66 
 
 		 1176 aa  750    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  36.8 
 
 		 1157 aa  653    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  53.66 
 
 		 1208 aa  670    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1629  transcription-repair coupling factor  37.81 
 
 		 1148 aa  652    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  52.02 
 
 		 1265 aa  663    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  36.27 
 
 		 1153 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  36.99 
 
 		 1162 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  34 
 
 		 1059 aa  647    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  41.96 
 
 		 1211 aa  756    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  36.94 
 
 		 1179 aa  657    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1176 aa  754    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  41.01 
 
 		 1150 aa  671    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  39.66 
 
 		 1176 aa  749    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  43.84 
 
 		 1188 aa  745    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  39.65 
 
 		 1182 aa  702    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1948  transcription-repair coupling factor  41.49 
 
 		 1198 aa  732    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  41.96 
 
 		 1211 aa  755    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0909  transcription-repair coupling factor  47.27 
 
 		 1054 aa  759    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  40.96 
 
 		 1157 aa  737    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  51.37 
 
 		 1246 aa  684    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3453  transcription-repair coupling factor  36.35 
 
 		 1122 aa  651    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  36.61 
 
 		 1162 aa  759    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  36.56 
 
 		 1162 aa  759    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  36.81 
 
 		 1143 aa  642    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  40.04 
 
 		 1165 aa  737    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  37.49 
 
 		 1160 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  37.39 
 
 		 1160 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1800  transcription-repair coupling factor  38.54 
 
 		 1166 aa  668    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  36.61 
 
 		 1178 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0039  transcription-repair coupling factor  37.05 
 
 		 1193 aa  646    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  40.09 
 
 		 1176 aa  751    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  50.75 
 
 		 1169 aa  672    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  37.28 
 
 		 1162 aa  699    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01528  transcription-repair coupling factor  36.41 
 
 		 1153 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  37.43 
 
 		 1165 aa  711    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  36.94 
 
 		 1157 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  38.42 
 
 		 1168 aa  689    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  47.23 
 
 		 1222 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  38.2 
 
 		 1178 aa  775    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  48.59 
 
 		 1189 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  38 
 
 		 1198 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  37.39 
 
 		 1160 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  42.5 
 
 		 1192 aa  710    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  41.18 
 
 		 1177 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  41.95 
 
 		 1193 aa  727    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  40.43 
 
 		 1224 aa  749    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  37.58 
 
 		 1155 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  41.96 
 
 		 1211 aa  755    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2204  transcription-repair coupling factor  35.03 
 
 		 1163 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0607404  normal  0.440495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  40.92 
 
 		 1212 aa  733    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  40.07 
 
 		 1173 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  38.62 
 
 		 1176 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  49.92 
 
 		 1176 aa  688    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  41.08 
 
 		 1159 aa  739    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>