More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1874 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  42.1 
 
 		 1855 aa  813    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 4334 aa  7829    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  39.43 
 
 		 3954 aa  956    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  34.38 
 
 		 2467 aa  560  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  36.56 
 
 		 1400 aa  427  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.19 
 
 		 1415 aa  427  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  35.93 
 
 		 1884 aa  391  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  31.22 
 
 		 4800 aa  373  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  35.97 
 
 		 824 aa  362  8e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.56 
 
 		 1363 aa  347  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.3 
 
 		 1279 aa  338  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  39.12 
 
 		 2807 aa  338  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  31.12 
 
 		 2954 aa  328  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  42.56 
 
 		 2133 aa  306  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  31.15 
 
 		 3026 aa  288  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  49.5 
 
 		 3209 aa  288  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  35.14 
 
 		 1534 aa  282  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  42.55 
 
 		 946 aa  280  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  30.2 
 
 		 2097 aa  274  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  35.69 
 
 		 1544 aa  266  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  45.29 
 
 		 2198 aa  256  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  35.2 
 
 		 1145 aa  255  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  35.18 
 
 		 1532 aa  253  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  40.04 
 
 		 1134 aa  252  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  29.16 
 
 		 1582 aa  249  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  29.43 
 
 		 1628 aa  248  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.14 
 
 		 1156 aa  247  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  28.37 
 
 		 14829 aa  247  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  36.02 
 
 		 1764 aa  246  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  37.82 
 
 		 1133 aa  245  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.6 
 
 		 2245 aa  239  7e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  34.47 
 
 		 1079 aa  238  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  30.97 
 
 		 1895 aa  236  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  27.34 
 
 		 15831 aa  233  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  33.23 
 
 		 1499 aa  228  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  47.87 
 
 		 3619 aa  226  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  45.72 
 
 		 3619 aa  226  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  30.61 
 
 		 1213 aa  223  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  46.94 
 
 		 3608 aa  221  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.29 
 
 		 2911 aa  221  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  35.32 
 
 		 965 aa  216  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  47.42 
 
 		 820 aa  216  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  36.25 
 
 		 860 aa  210  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  31.5 
 
 		 2107 aa  208  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  39.08 
 
 		 1197 aa  206  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  28.68 
 
 		 3598 aa  203  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  39.37 
 
 		 595 aa  202  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  43.98 
 
 		 768 aa  202  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.85 
 
 		 2689 aa  201  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.69 
 
 		 1795 aa  196  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  30.12 
 
 		 2836 aa  194  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.66 
 
 		 2678 aa  189  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.44 
 
 		 1390 aa  186  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  42.77 
 
 		 395 aa  184  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  37.06 
 
 		 9867 aa  184  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  37.92 
 
 		 907 aa  184  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  29.55 
 
 		 1217 aa  182  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  42.14 
 
 		 395 aa  181  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  36.1 
 
 		 851 aa  181  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.8 
 
 		 3427 aa  180  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.84 
 
 		 4798 aa  179  8e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  38.29 
 
 		 589 aa  179  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.59 
 
 		 855 aa  177  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.25 
 
 		 833 aa  174  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  42.26 
 
 		 2105 aa  174  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  36.61 
 
 		 1164 aa  170  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.1 
 
 		 556 aa  169  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  30.23 
 
 		 1072 aa  167  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  34.03 
 
 		 1421 aa  167  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  34.14 
 
 		 2950 aa  163  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  32.35 
 
 		 1480 aa  161  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  42.18 
 
 		 1610 aa  160  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  52.05 
 
 		 982 aa  159  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  38.16 
 
 		 613 aa  159  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  48.99 
 
 		 475 aa  158  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1424 aa  158  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  31.17 
 
 		 1286 aa  157  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  41.81 
 
 		 833 aa  157  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  43.8 
 
 		 475 aa  157  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  30.85 
 
 		 1814 aa  157  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  44.79 
 
 		 1610 aa  156  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.56 
 
 		 980 aa  155  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  53.29 
 
 		 2461 aa  155  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  39.37 
 
 		 462 aa  155  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.62 
 
 		 1029 aa  153  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  40.62 
 
 		 1029 aa  153  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  39.38 
 
 		 387 aa  152  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  45.56 
 
 		 503 aa  150  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  45.52 
 
 		 341 aa  150  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 1789 aa  149  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  43.13 
 
 		 526 aa  148  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 503 aa  148  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.78 
 
 		 2667 aa  148  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  44.06 
 
 		 727 aa  147  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  46.43 
 
 		 491 aa  146  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  36.56 
 
 		 574 aa  145  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  35.12 
 
 		 795 aa  145  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  40.51 
 
 		 437 aa  144  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  28.8 
 
 		 4723 aa  143  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  43.25 
 
 		 1287 aa  142  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>