242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6378 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 552 aa  1124    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  74.06 
 
 		 535 aa  839    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  75.14 
 
 		 550 aa  835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  75.42 
 
 		 551 aa  875    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  30.09 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 889 aa  140  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.54 
 
 		 786 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.66 
 
 		 572 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 		 1150 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1150 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 657 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.5 
 
 		 569 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.52 
 
 		 505 aa  113  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  26.81 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 564 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.56 
 
 		 526 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.3 
 
 		 543 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.03 
 
 		 556 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.47 
 
 		 543 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 547 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.34 
 
 		 570 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.16 
 
 		 593 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.29 
 
 		 470 aa  102  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.08 
 
 		 532 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  26.96 
 
 		 622 aa  100  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  24.13 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.63 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.3 
 
 		 515 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 563 aa  97.8  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.76 
 
 		 586 aa  97.4  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.52 
 
 		 583 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.5 
 
 		 511 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 567 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 577 aa  94.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 577 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 578 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.46 
 
 		 532 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1152 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.82 
 
 		 1152 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 578 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.07 
 
 		 623 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.27 
 
 		 553 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.91 
 
 		 1132 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.02 
 
 		 566 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.77 
 
 		 561 aa  87.4  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.8 
 
 		 550 aa  87  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.18 
 
 		 570 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.26 
 
 		 520 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  27.27 
 
 		 563 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  26.12 
 
 		 552 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  26.2 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  26.24 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  26.24 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  26.2 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  26.2 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  26.24 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  25.95 
 
 		 696 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3482  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  26.61 
 
 		 573 aa  83.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  22.91 
 
 		 745 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 581 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.78 
 
 		 556 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0892  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.19 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0880  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.19 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3184  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.57 
 
 		 530 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.37 
 
 		 526 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.78 
 
 		 529 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.65 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.39 
 
 		 526 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3120  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.63 
 
 		 555 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0857  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.8 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2998  GMC family oxidoreductase  23.77 
 
 		 563 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.48 
 
 		 545 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.9 
 
 		 556 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24 
 
 		 572 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 		 533 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3396  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 		 533 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  24.18 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3863  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.23 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3284  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.52 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.39 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.13 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4189  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.17 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.17 
 
 		 570 aa  77  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.72 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0882  GMC family oxidoreductase  25.21 
 
 		 533 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.45 
 
 		 532 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  26.12 
 
 		 629 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.29 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.01 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3596  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.64 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.32 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  30.61 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 587 aa  75.1  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.81 
 
 		 531 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>