More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2606 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  100 
 
 		 710 aa  1478    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  27.88 
 
 		 671 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  26.64 
 
 		 679 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  25.87 
 
 		 903 aa  194  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 638 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  28.7 
 
 		 631 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  25.41 
 
 		 658 aa  184  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  26.91 
 
 		 626 aa  181  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  29.42 
 
 		 630 aa  177  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  26.29 
 
 		 641 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  26.05 
 
 		 631 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.43 
 
 		 673 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  25.04 
 
 		 656 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  25.38 
 
 		 648 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  27.23 
 
 		 648 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  26.56 
 
 		 668 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  27.11 
 
 		 620 aa  146  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  23.79 
 
 		 640 aa  145  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  28.24 
 
 		 643 aa  144  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  24.97 
 
 		 757 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  27.96 
 
 		 669 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  26.89 
 
 		 525 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  29.82 
 
 		 660 aa  134  7.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  25.53 
 
 		 642 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  25.18 
 
 		 594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  29.87 
 
 		 650 aa  132  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  27.62 
 
 		 653 aa  131  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  29.06 
 
 		 630 aa  127  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  25.09 
 
 		 509 aa  124  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  24.91 
 
 		 704 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  26.28 
 
 		 670 aa  120  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  29.79 
 
 		 677 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  27.19 
 
 		 585 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  27.38 
 
 		 665 aa  120  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  45.38 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  26.5 
 
 		 694 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  27.89 
 
 		 734 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  29.74 
 
 		 645 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  24.24 
 
 		 666 aa  117  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  25.79 
 
 		 613 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  25.42 
 
 		 672 aa  115  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  25 
 
 		 537 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  25.14 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  27.02 
 
 		 517 aa  99  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  32.02 
 
 		 412 aa  98.2  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  27.89 
 
 		 510 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  37.59 
 
 		 778 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  29.27 
 
 		 712 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 		 296 aa  92.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  27.11 
 
 		 656 aa  92  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  26.42 
 
 		 432 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  46.09 
 
 		 429 aa  89.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  24.66 
 
 		 813 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 798 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.35 
 
 		 506 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 362 aa  87  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  33.33 
 
 		 424 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  36.64 
 
 		 342 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  38.6 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  36.21 
 
 		 230 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  38.52 
 
 		 519 aa  82  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  34.71 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.13 
 
 		 266 aa  80.1  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 231 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.51 
 
 		 447 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  39.81 
 
 		 320 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  29.29 
 
 		 729 aa  80.5  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  38.05 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.33 
 
 		 707 aa  79  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  38.66 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  41.74 
 
 		 239 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 1755 aa  78.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  36.36 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 1026 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.39 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  34.82 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  39.81 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  41.86 
 
 		 623 aa  77.4  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.54 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  33.62 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.54 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.22 
 
 		 466 aa  77  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.29 
 
 		 422 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  32.12 
 
 		 468 aa  77  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  36.7 
 
 		 225 aa  77  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  34.82 
 
 		 230 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 		 417 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  33.62 
 
 		 230 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  30.91 
 
 		 240 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 727 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>