More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09423 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  50.15 
 
 		 669 aa  669    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5111  DNA ligase, NAD-dependent  48.77 
 
 		 695 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246917  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  51.29 
 
 		 670 aa  699    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  54.44 
 
 		 670 aa  751    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2539  DNA ligase, NAD-dependent  47.9 
 
 		 696 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  67.63 
 
 		 662 aa  941    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  100 
 
 		 664 aa  1367    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  69.73 
 
 		 668 aa  970    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1926  hypothetical protein  45.26 
 
 		 671 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  44.69 
 
 		 678 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  43.33 
 
 		 667 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.44 
 
 		 679 aa  558  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  45.14 
 
 		 672 aa  560  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.74 
 
 		 670 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.68 
 
 		 669 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  44.04 
 
 		 670 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.8 
 
 		 669 aa  555  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.38 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.38 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.38 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  45.45 
 
 		 674 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.38 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.38 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.23 
 
 		 669 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  45.45 
 
 		 674 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.38 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  44.16 
 
 		 670 aa  549  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.53 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.23 
 
 		 669 aa  548  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.33 
 
 		 676 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.46 
 
 		 670 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  43.3 
 
 		 684 aa  547  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  44.19 
 
 		 681 aa  546  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2016  DNA ligase, NAD-dependent  42.19 
 
 		 673 aa  544  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  42.86 
 
 		 659 aa  545  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  41.94 
 
 		 670 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  42.56 
 
 		 708 aa  540  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  41.83 
 
 		 671 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  41.53 
 
 		 708 aa  536  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0463  DNA ligase, NAD-dependent  42.54 
 
 		 684 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0475  DNA ligase, NAD-dependent  41.07 
 
 		 676 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.82 
 
 		 774 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  43.35 
 
 		 700 aa  531  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  41.45 
 
 		 678 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  43.59 
 
 		 673 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  42.88 
 
 		 663 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0427  DNA ligase, NAD-dependent  42.64 
 
 		 675 aa  530  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  41.47 
 
 		 675 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  40.66 
 
 		 667 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  40.39 
 
 		 673 aa  528  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  41.23 
 
 		 690 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  40.66 
 
 		 667 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  41.21 
 
 		 677 aa  523  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  40.81 
 
 		 665 aa  525  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  42.39 
 
 		 682 aa  525  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  41.48 
 
 		 673 aa  523  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0483  DNA ligase, NAD-dependent  41.08 
 
 		 674 aa  524  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  43.42 
 
 		 662 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  42.38 
 
 		 663 aa  521  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  41.97 
 
 		 671 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.24 
 
 		 680 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  41.22 
 
 		 680 aa  519  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  42.07 
 
 		 677 aa  522  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  41.94 
 
 		 684 aa  521  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  39.33 
 
 		 711 aa  521  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  41.73 
 
 		 725 aa  520  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  40.42 
 
 		 683 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  42.17 
 
 		 662 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.39 
 
 		 673 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.54 
 
 		 670 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.08 
 
 		 670 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.54 
 
 		 670 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  41.48 
 
 		 670 aa  517  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  43.01 
 
 		 666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  42.79 
 
 		 672 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  40.61 
 
 		 695 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.54 
 
 		 670 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  41.3 
 
 		 672 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  41.14 
 
 		 668 aa  515  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  40 
 
 		 711 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.44 
 
 		 738 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  41.4 
 
 		 672 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  42.41 
 
 		 668 aa  514  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  40.81 
 
 		 669 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.09 
 
 		 671 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  40.84 
 
 		 668 aa  512  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  39.55 
 
 		 703 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.68 
 
 		 696 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  39 
 
 		 681 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.09 
 
 		 671 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  40.12 
 
 		 680 aa  512  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  40.06 
 
 		 671 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  40.06 
 
 		 671 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.09 
 
 		 671 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.69 
 
 		 673 aa  511  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  41.36 
 
 		 690 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  39.09 
 
 		 671 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  39.09 
 
 		 671 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  40.66 
 
 		 689 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.09 
 
 		 671 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>