More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0371 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  100 
 
 		 471 aa  974    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  60.64 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  57.82 
 
 		 411 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  51.13 
 
 		 391 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  52.85 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  52.76 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  50.38 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  47.02 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  48.98 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  47.64 
 
 		 392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  48.48 
 
 		 392 aa  351  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  48.87 
 
 		 386 aa  349  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  44.97 
 
 		 407 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  44.7 
 
 		 407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  38.24 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  32.03 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  28.79 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  28.79 
 
 		 401 aa  146  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03390  hypothetical protein  47.4 
 
 		 169 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000152663  unclonable  2.59325e-22 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  27.25 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  27.19 
 
 		 446 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  27.25 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  26.95 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  28.42 
 
 		 436 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  27.63 
 
 		 428 aa  128  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  34.47 
 
 		 338 aa  123  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  26.9 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  25.7 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  26.88 
 
 		 411 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  25.52 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  29.63 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  25.69 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  27.69 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  30.06 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  24.13 
 
 		 411 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  24.13 
 
 		 411 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  24.13 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.17 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  27.13 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.73 
 
 		 414 aa  103  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  31.5 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  25.26 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.03 
 
 		 390 aa  99.8  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  29.28 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  26.99 
 
 		 341 aa  99.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  29.57 
 
 		 276 aa  98.6  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  29.92 
 
 		 369 aa  99  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  32.98 
 
 		 293 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.95 
 
 		 370 aa  97.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.54 
 
 		 378 aa  97.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 397 aa  97.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  31.88 
 
 		 292 aa  94.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.25 
 
 		 392 aa  95.1  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_010814  Glov_2319  integrase family protein  26.76 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  28.47 
 
 		 302 aa  92.8  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.12 
 
 		 297 aa  92.4  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  28.12 
 
 		 297 aa  92.4  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  30.04 
 
 		 273 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.28 
 
 		 305 aa  90.1  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  32 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.87 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  32.47 
 
 		 396 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.22 
 
 		 260 aa  87.4  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.52 
 
 		 379 aa  86.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  21.53 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.18 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  30.64 
 
 		 190 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.62 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  34.66 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  24.55 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  32.8 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  27.06 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.27 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  27.06 
 
 		 357 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.34 
 
 		 275 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  31.42 
 
 		 257 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  23.89 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.26 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  23.12 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.89 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.6 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  25.79 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.25 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.25 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.03 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.96 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.76 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.76 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  26.67 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.79 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  25.18 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  24.1 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.08 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  24.46 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  29.44 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  23.68 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>