More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0210 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  48.08 
 
 		 808 aa  670    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  48.51 
 
 		 806 aa  672    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  47.89 
 
 		 709 aa  657    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  48.79 
 
 		 757 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  48.08 
 
 		 806 aa  670    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  47.94 
 
 		 808 aa  668    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  47.94 
 
 		 804 aa  669    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  48.22 
 
 		 810 aa  670    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  50.86 
 
 		 762 aa  709    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  47.39 
 
 		 814 aa  664    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  58.01 
 
 		 706 aa  800    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  48.22 
 
 		 806 aa  671    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  48.08 
 
 		 792 aa  671    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  47.94 
 
 		 808 aa  668    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  49.72 
 
 		 706 aa  669    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  47.87 
 
 		 716 aa  652    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  52.75 
 
 		 770 aa  678    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  100 
 
 		 715 aa  1435    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  47.29 
 
 		 788 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  51.86 
 
 		 758 aa  712    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  46.19 
 
 		 751 aa  638    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  46.19 
 
 		 751 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  48.22 
 
 		 812 aa  667    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  49.58 
 
 		 903 aa  634  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  46.48 
 
 		 705 aa  632  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  46.64 
 
 		 722 aa  616  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  42.28 
 
 		 792 aa  592  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  46.34 
 
 		 759 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  41.71 
 
 		 790 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  41.71 
 
 		 790 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  44.68 
 
 		 763 aa  571  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  45.1 
 
 		 752 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  42.25 
 
 		 763 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  42.88 
 
 		 716 aa  546  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  44.04 
 
 		 777 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  42.22 
 
 		 710 aa  526  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  40.87 
 
 		 704 aa  527  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  42.22 
 
 		 710 aa  528  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  40.67 
 
 		 766 aa  516  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  38.05 
 
 		 709 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  41.67 
 
 		 720 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  38.56 
 
 		 708 aa  509  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  44.21 
 
 		 751 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  40.19 
 
 		 774 aa  502  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  44.44 
 
 		 737 aa  501  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  40.62 
 
 		 758 aa  500  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  43.86 
 
 		 737 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  38.64 
 
 		 801 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  39.68 
 
 		 737 aa  488  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  38.27 
 
 		 810 aa  483  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  41.26 
 
 		 755 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  38.46 
 
 		 808 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  39.36 
 
 		 876 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  41.19 
 
 		 1055 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  38.32 
 
 		 808 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  38.46 
 
 		 808 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  39.34 
 
 		 726 aa  478  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  38.3 
 
 		 809 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  39.3 
 
 		 864 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  39.64 
 
 		 1182 aa  475  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  38.76 
 
 		 807 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  39.29 
 
 		 848 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  38.63 
 
 		 871 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  38.29 
 
 		 870 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  38.62 
 
 		 807 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  39.07 
 
 		 742 aa  472  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  36.07 
 
 		 827 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  38.38 
 
 		 807 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  38.52 
 
 		 807 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  40.69 
 
 		 863 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  38.52 
 
 		 807 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  38.85 
 
 		 857 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  39.62 
 
 		 735 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  39.12 
 
 		 828 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  37.85 
 
 		 937 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  38.71 
 
 		 857 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  38.18 
 
 		 824 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  39.43 
 
 		 808 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  38.07 
 
 		 828 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  38.73 
 
 		 701 aa  464  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  39.04 
 
 		 840 aa  464  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  38.71 
 
 		 857 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  43.06 
 
 		 813 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  38.21 
 
 		 826 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  39.56 
 
 		 805 aa  462  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  38.43 
 
 		 833 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  38.11 
 
 		 895 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  34.78 
 
 		 735 aa  461  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  37.84 
 
 		 827 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  37.97 
 
 		 810 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  37.84 
 
 		 827 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  37.84 
 
 		 827 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  38.57 
 
 		 859 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  39.46 
 
 		 813 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  37.92 
 
 		 817 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  38.94 
 
 		 877 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  39.46 
 
 		 813 aa  459  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  35.43 
 
 		 726 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  39.46 
 
 		 813 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  39.48 
 
 		 907 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>