96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1729 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1729  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  835    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000763037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  39.55 
 
 		 402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3099  integrase family protein  35.97 
 
 		 441 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.979662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5173  integrase family protein  32.51 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1864  hypothetical protein  68.89 
 
 		 165 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000540239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  26.68 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  26.11 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  27.49 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  27.34 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  24.62 
 
 		 415 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  24.77 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  27.27 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  26.15 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  26.15 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  24.94 
 
 		 412 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  22.81 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  26.03 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5872  integrase family protein  24.51 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1768  hypothetical protein  23.33 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  20.24 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  23.64 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  22.17 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  23.08 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  23.46 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  25.47 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  22.74 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  22.26 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  24.73 
 
 		 308 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  22.95 
 
 		 436 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.65 
 
 		 284 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  23.67 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  25.18 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  27.61 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  22.07 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  21.17 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.67 
 
 		 313 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0194  tyrosine recombinase XerC subunit  22.1 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  22.83 
 
 		 312 aa  50.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 311 aa  50.1  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.34 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.56 
 
 		 298 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  25.95 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  26.01 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  22.81 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  29.58 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  25.24 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  23.31 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.43 
 
 		 325 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  21.76 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  24.37 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.59 
 
 		 302 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  22.61 
 
 		 302 aa  47  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3291  integrase family protein  24.29 
 
 		 450 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671392  normal  0.608056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 301 aa  47  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.52 
 
 		 298 aa  46.6  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  25.19 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0533  tyrosine recombinase XerD  22.11 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  22.76 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.41 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0430  site-specific recombinase XerD-like  23.53 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00678047  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  28.66 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  24 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.75 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  23.69 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  24 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3243  tyrosine recombinase XerC subunit  23.58 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  24.07 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  22.73 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.31 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2237  site-specific recombinase XerD-like  23.89 
 
 		 225 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0311543  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 343 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.52 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  23.79 
 
 		 298 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  34.74 
 
 		 354 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  21.45 
 
 		 300 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 278 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  23.74 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  25.09 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  23.66 
 
 		 307 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  23.03 
 
 		 335 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  24.07 
 
 		 306 aa  43.5  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 301 aa  43.5  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  24.31 
 
 		 331 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  27.33 
 
 		 290 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.42 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  27.33 
 
 		 290 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  28.45 
 
 		 457 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  26.11 
 
 		 343 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  24.22 
 
 		 299 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>