116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1654 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1654  dynamin  100 
 
 
686 aa  1398    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  42.96 
 
 
666 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  25.44 
 
 
602 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  29.49 
 
 
627 aa  159  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  27.1 
 
 
608 aa  145  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  24.56 
 
 
640 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  27.59 
 
 
605 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  33.2 
 
 
614 aa  127  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  22.63 
 
 
619 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  22.63 
 
 
619 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  22.88 
 
 
619 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  25.57 
 
 
614 aa  124  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  25.57 
 
 
614 aa  124  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  27.06 
 
 
603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  32.03 
 
 
407 aa  108  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  22.2 
 
 
602 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  28.25 
 
 
605 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  28.99 
 
 
588 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25.79 
 
 
444 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  26.4 
 
 
624 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  31.65 
 
 
641 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  24.14 
 
 
617 aa  97.4  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  25.88 
 
 
585 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25.89 
 
 
620 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  27.93 
 
 
610 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  30.52 
 
 
626 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29 
 
 
548 aa  91.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  21.81 
 
 
693 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.14 
 
 
546 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  29.38 
 
 
506 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  31.47 
 
 
632 aa  81.3  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  27.03 
 
 
583 aa  78.2  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  23.21 
 
 
679 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  27.14 
 
 
952 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  25.51 
 
 
602 aa  71.6  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.32 
 
 
585 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  28.57 
 
 
664 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  29.78 
 
 
564 aa  68.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  22.39 
 
 
645 aa  68.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  28.46 
 
 
585 aa  67.4  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  25.82 
 
 
712 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  25.82 
 
 
712 aa  64.3  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  24.5 
 
 
1249 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  25.74 
 
 
1219 aa  60.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  25.74 
 
 
1219 aa  60.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2958  GTPase  25.7 
 
 
768 aa  60.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  25.74 
 
 
1219 aa  60.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  25.63 
 
 
1219 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  25.74 
 
 
1219 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  25.74 
 
 
1219 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.15 
 
 
587 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  32.2 
 
 
1228 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  22.43 
 
 
648 aa  58.5  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  30.07 
 
 
674 aa  58.5  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  26.83 
 
 
1219 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  27.81 
 
 
589 aa  58.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  26.55 
 
 
390 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  27.98 
 
 
1219 aa  57.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  26.21 
 
 
1219 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  27.23 
 
 
692 aa  56.6  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  26.44 
 
 
1146 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  26.44 
 
 
1146 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  25.85 
 
 
1219 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.57 
 
 
601 aa  56.6  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  27.13 
 
 
1219 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  26.04 
 
 
719 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  22.01 
 
 
660 aa  55.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  22.01 
 
 
660 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  29.52 
 
 
493 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  26.16 
 
 
741 aa  55.1  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2664  GTP-binding protein, HSR1-like  34.69 
 
 
581 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2033  GTP-binding protein, HSR1-related  31.15 
 
 
569 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291841 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  24.68 
 
 
599 aa  53.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.29 
 
 
655 aa  52.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  22.01 
 
 
709 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  24.05 
 
 
654 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  22.77 
 
 
649 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  27.23 
 
 
496 aa  52  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  23.49 
 
 
655 aa  51.6  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  31.91 
 
 
648 aa  51.2  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  20.92 
 
 
672 aa  50.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  23.37 
 
 
1145 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  27.56 
 
 
659 aa  50.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  30 
 
 
527 aa  50.4  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  27.39 
 
 
468 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  25.65 
 
 
1164 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  24.81 
 
 
496 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  27.15 
 
 
570 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  25.77 
 
 
653 aa  48.9  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  26.06 
 
 
658 aa  48.5  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  23.66 
 
 
728 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  23.75 
 
 
615 aa  48.1  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  24.47 
 
 
610 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  26.99 
 
 
648 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  26.89 
 
 
501 aa  48.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  23.81 
 
 
551 aa  47.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1683  labile enterotoxin output A  30.23 
 
 
568 aa  47.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  26.32 
 
 
523 aa  47.4  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  23.18 
 
 
652 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  25.43 
 
 
741 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>