80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3083 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  100 
 
 
496 aa  973    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  47.49 
 
 
501 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  48.13 
 
 
501 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  43.04 
 
 
493 aa  343  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  43.22 
 
 
496 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  43.53 
 
 
468 aa  332  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  43.43 
 
 
502 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  43.43 
 
 
502 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  43.43 
 
 
502 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  42.66 
 
 
527 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  42.44 
 
 
478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  37.21 
 
 
420 aa  249  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  30.42 
 
 
524 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  27.33 
 
 
533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  37.15 
 
 
497 aa  150  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  33.33 
 
 
503 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  33.47 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  32.71 
 
 
610 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  29.82 
 
 
1164 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  37.93 
 
 
615 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  26.6 
 
 
693 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  26.11 
 
 
674 aa  70.5  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  36.43 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  24.9 
 
 
655 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  31.91 
 
 
605 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  29.5 
 
 
666 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  25.24 
 
 
569 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  25.77 
 
 
569 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  24.7 
 
 
599 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  31.4 
 
 
601 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  26.16 
 
 
614 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  32.89 
 
 
608 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  28.26 
 
 
620 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  29.46 
 
 
614 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  29.46 
 
 
614 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.5 
 
 
587 aa  57.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  34.03 
 
 
603 aa  57.4  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  29.17 
 
 
605 aa  56.2  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  32.86 
 
 
602 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  30 
 
 
605 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  25.77 
 
 
569 aa  55.5  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  24.31 
 
 
712 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  24.31 
 
 
712 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  33.59 
 
 
743 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  28.66 
 
 
588 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  24.08 
 
 
610 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  24.24 
 
 
390 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  31.39 
 
 
570 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  27.49 
 
 
585 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  28.85 
 
 
976 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  29.59 
 
 
952 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  25 
 
 
719 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  33.02 
 
 
569 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  23.2 
 
 
444 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  31.03 
 
 
551 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  30.22 
 
 
626 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  27.42 
 
 
679 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  32.43 
 
 
537 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  26.5 
 
 
587 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.42 
 
 
548 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  28.32 
 
 
568 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2227  hypothetical protein  41.1 
 
 
888 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  24.63 
 
 
583 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  27.08 
 
 
1228 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  36.92 
 
 
793 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  31.5 
 
 
641 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  24.56 
 
 
585 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  26.2 
 
 
1219 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  30 
 
 
686 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  25.87 
 
 
1219 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  27.42 
 
 
664 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  25.67 
 
 
1219 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  22.08 
 
 
585 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  25.67 
 
 
1219 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  25.67 
 
 
1219 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  25.67 
 
 
1219 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  25.67 
 
 
1219 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  25.67 
 
 
1219 aa  43.9  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  24.41 
 
 
546 aa  43.9  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  42.59 
 
 
794 aa  43.5  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>