86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6053 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1155    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  36.02 
 
 		 587 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  42.86 
 
 		 599 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  25.99 
 
 		 587 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  31.72 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  31.72 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  32.64 
 
 		 585 aa  70.1  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  37.86 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26.7 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  30 
 
 		 674 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  33.96 
 
 		 601 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  30.71 
 
 		 620 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  28.17 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  25.53 
 
 		 589 aa  67.8  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  30.34 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  26.7 
 
 		 679 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  26.51 
 
 		 564 aa  66.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.06 
 
 		 548 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  35.24 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  33.33 
 
 		 569 aa  63.5  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  33.33 
 
 		 569 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  27.23 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  27.62 
 
 		 664 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  29.25 
 
 		 615 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  25.75 
 
 		 583 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  29.51 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  27.17 
 
 		 1164 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  34.29 
 
 		 605 aa  57.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  32.71 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  31.39 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  31.48 
 
 		 569 aa  57  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  25.56 
 
 		 632 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  29.27 
 
 		 719 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  32.71 
 
 		 536 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  25.87 
 
 		 621 aa  55.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  23.19 
 
 		 614 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  33.57 
 
 		 603 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1146 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  24.21 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1146 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  46.27 
 
 		 655 aa  52.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  31.39 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  37.04 
 
 		 789 aa  52  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  22.75 
 
 		 585 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  40.54 
 
 		 648 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  42.42 
 
 		 728 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  42.42 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  30.5 
 
 		 666 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  32.5 
 
 		 976 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  42.42 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  44 
 
 		 692 aa  48.5  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  28.29 
 
 		 1249 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  42.31 
 
 		 793 aa  48.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  41.33 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  41.33 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  26.83 
 
 		 1228 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  23.76 
 
 		 588 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  27.13 
 
 		 712 aa  47  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0312  hypothetical protein  38.98 
 
 		 784 aa  46.6  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0131093 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  27.13 
 
 		 712 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  50 
 
 		 1219 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  27.34 
 
 		 1219 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  27.34 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  40 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  27.34 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  40 
 
 		 1219 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  53.49 
 
 		 1145 aa  46.2  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3883  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 		 742 aa  45.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4349  hypothetical protein  29.37 
 
 		 742 aa  45.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  43.75 
 
 		 794 aa  45.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03941  hypothetical protein  29.37 
 
 		 742 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  28.24 
 
 		 602 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4574  hypothetical protein  29.37 
 
 		 742 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03980  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  29.37 
 
 		 742 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4663  hypothetical protein  29.37 
 
 		 742 aa  45.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1219 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5622  hypothetical protein  38.98 
 
 		 742 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.889676 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1396  hypothetical protein  39.06 
 
 		 794 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.318277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  31.13 
 
 		 493 aa  45.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  39.06 
 
 		 798 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2971  hypothetical protein  31.96 
 
 		 788 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1083  hypothetical protein  26.71 
 
 		 494 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  45.83 
 
 		 743 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  40.38 
 
 		 693 aa  43.5  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>