65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0272 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  87.71 
 
 
502 aa  734    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  87.29 
 
 
496 aa  740    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  87.71 
 
 
502 aa  735    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  87.71 
 
 
502 aa  735    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  100 
 
 
468 aa  917    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  77.68 
 
 
493 aa  698    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  43.53 
 
 
496 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  41.14 
 
 
501 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  41.27 
 
 
501 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  37.73 
 
 
527 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  32.98 
 
 
478 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  33.41 
 
 
420 aa  179  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  26.26 
 
 
524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  26.63 
 
 
533 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  29.49 
 
 
536 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  29.39 
 
 
503 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  32.46 
 
 
497 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  32.76 
 
 
610 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  27.07 
 
 
674 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  25.4 
 
 
615 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  31.96 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  28.76 
 
 
605 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  31.3 
 
 
601 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  31.08 
 
 
620 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  27.46 
 
 
1164 aa  56.6  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  27.45 
 
 
608 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.38 
 
 
587 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  26.18 
 
 
712 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  26.18 
 
 
712 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  22.5 
 
 
444 aa  53.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  25.64 
 
 
693 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  20.86 
 
 
610 aa  51.2  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  31.11 
 
 
599 aa  50.8  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.22 
 
 
588 aa  50.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  26.76 
 
 
564 aa  50.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.28 
 
 
614 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.28 
 
 
614 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  30.34 
 
 
743 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  32.43 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  32.3 
 
 
641 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  26.62 
 
 
666 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.74 
 
 
614 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  28.11 
 
 
679 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  38.57 
 
 
794 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  23.79 
 
 
655 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.34 
 
 
583 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.43 
 
 
548 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03941  hypothetical protein  40.32 
 
 
742 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4349  hypothetical protein  40.32 
 
 
742 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5622  hypothetical protein  38.81 
 
 
742 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.889676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4574  hypothetical protein  40.32 
 
 
742 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4663  hypothetical protein  40.32 
 
 
742 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03980  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  40.32 
 
 
742 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  27.39 
 
 
686 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3883  conserved hypothetical protein  38.81 
 
 
742 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1396  hypothetical protein  47.73 
 
 
794 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.318277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  47.73 
 
 
798 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0611355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0312  hypothetical protein  40.32 
 
 
784 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0131093 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  27.78 
 
 
719 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.54 
 
 
585 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  45.24 
 
 
537 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  30.3 
 
 
627 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  29.41 
 
 
602 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  45.24 
 
 
569 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  47.27 
 
 
737 aa  43.5  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>