76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0556 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 602 aa  1187    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  46.91 
 
 		 624 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  43.6 
 
 		 627 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  37.06 
 
 		 602 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  36.66 
 
 		 608 aa  340  5e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  35.54 
 
 		 619 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  35.54 
 
 		 619 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  35.57 
 
 		 619 aa  330  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  36.9 
 
 		 640 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  36.33 
 
 		 605 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  34.91 
 
 		 603 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  32.57 
 
 		 645 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25.63 
 
 		 686 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  26.47 
 
 		 666 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  29.02 
 
 		 620 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  31.62 
 
 		 610 aa  84.3  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  33.53 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  29.82 
 
 		 588 aa  75.1  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  30.46 
 
 		 617 aa  73.6  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  29.1 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  27.39 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  32.04 
 
 		 626 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  31.03 
 
 		 679 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  20.19 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  29.08 
 
 		 585 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  25.31 
 
 		 743 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  28.19 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  28.49 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  24 
 
 		 719 aa  63.9  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  23.78 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  26.01 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  26.01 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  23.74 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  29.03 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  30.77 
 
 		 496 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.41 
 
 		 548 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.31 
 
 		 599 aa  54.7  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  27.49 
 
 		 712 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  27.49 
 
 		 712 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.22 
 
 		 585 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  27.59 
 
 		 583 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  25.81 
 
 		 551 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  33.53 
 
 		 653 aa  50.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  24.58 
 
 		 1228 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  29.41 
 
 		 660 aa  50.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  23.04 
 
 		 952 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  29.41 
 
 		 660 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  26.12 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  23.99 
 
 		 648 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  22.49 
 
 		 615 aa  48.9  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  27.16 
 
 		 652 aa  48.5  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  25.73 
 
 		 693 aa  47.8  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  31.29 
 
 		 659 aa  47.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  33.12 
 
 		 527 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  25.95 
 
 		 693 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  23.06 
 
 		 648 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.5 
 
 		 587 aa  47.4  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  22.96 
 
 		 1249 aa  47.4  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  24.09 
 
 		 652 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  31.55 
 
 		 658 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.22 
 
 		 564 aa  47  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  25.29 
 
 		 664 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  29.11 
 
 		 649 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  28.1 
 
 		 741 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  30.89 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  28.23 
 
 		 502 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  28.23 
 
 		 502 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  28.23 
 
 		 502 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  27.45 
 
 		 655 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  35.85 
 
 		 305 aa  45.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  28.68 
 
 		 654 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  26.25 
 
 		 589 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  22.69 
 
 		 927 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2958  GTPase  25.18 
 
 		 768 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  31.54 
 
 		 737 aa  44.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25.11 
 
 		 546 aa  43.5  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>