49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1149 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1191    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  29.53 
 
 		 617 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  32.39 
 
 		 626 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  28.79 
 
 		 610 aa  141  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  29.57 
 
 		 666 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  30.06 
 
 		 603 aa  92.8  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  25.93 
 
 		 627 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  29.48 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  26.22 
 
 		 686 aa  74.7  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  33.88 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  28.63 
 
 		 641 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  25.39 
 
 		 602 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25.13 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  29.67 
 
 		 608 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  29.3 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  28.12 
 
 		 585 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  27.22 
 
 		 614 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  27.22 
 
 		 614 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  28.98 
 
 		 407 aa  55.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.75 
 
 		 589 aa  54.3  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  30.24 
 
 		 640 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.46 
 
 		 1249 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  25 
 
 		 588 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25 
 
 		 614 aa  51.6  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  27.89 
 
 		 605 aa  51.6  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  27.71 
 
 		 585 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1219 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1219 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  29.93 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  29.93 
 
 		 619 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  29.93 
 
 		 619 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1219 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.41 
 
 		 1219 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  23.41 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1219 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.29 
 
 		 583 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  29.74 
 
 		 645 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  22.93 
 
 		 1219 aa  48.9  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  29.58 
 
 		 624 aa  47.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.41 
 
 		 1219 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  43.82 
 
 		 669 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.78 
 
 		 548 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  28.89 
 
 		 564 aa  47  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.15 
 
 		 546 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  36.11 
 
 		 299 aa  44.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  31.43 
 
 		 641 aa  43.9  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>