55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36820 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1243    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  46.91 
 
 		 602 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  36.08 
 
 		 627 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  35.13 
 
 		 602 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  35.67 
 
 		 608 aa  310  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  34.43 
 
 		 619 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  34.43 
 
 		 619 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  34.43 
 
 		 619 aa  303  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  33.86 
 
 		 640 aa  279  9e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  31.16 
 
 		 603 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  31.76 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  29.28 
 
 		 645 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  26.97 
 
 		 686 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  24.87 
 
 		 666 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  26.73 
 
 		 620 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.07 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  24.71 
 
 		 610 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  25.41 
 
 		 617 aa  68.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  32.6 
 
 		 626 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.48 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  25.66 
 
 		 588 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  20.96 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  23.1 
 
 		 614 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  23.1 
 
 		 614 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.11 
 
 		 679 aa  56.2  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  22.48 
 
 		 927 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3865  hypothetical protein  22.48 
 
 		 927 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  27.43 
 
 		 407 aa  55.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3518  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 		 927 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3609  hypothetical protein  22.37 
 
 		 927 aa  53.9  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3896  hypothetical protein  22.37 
 
 		 927 aa  53.9  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1433  hypothetical protein  22.22 
 
 		 927 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.219985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  25.65 
 
 		 658 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  25.4 
 
 		 585 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  26.3 
 
 		 654 aa  53.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  22.47 
 
 		 719 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3777  hypothetical protein  22.1 
 
 		 927 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148359 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  21.55 
 
 		 692 aa  52.4  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3506  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 927 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0255227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  27.68 
 
 		 641 aa  51.6  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  22.3 
 
 		 789 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  27.46 
 
 		 585 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  27.03 
 
 		 743 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  29.37 
 
 		 741 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  25.76 
 
 		 659 aa  47.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  24.53 
 
 		 655 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  25.54 
 
 		 672 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  24.64 
 
 		 660 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  21.43 
 
 		 390 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.34 
 
 		 587 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1984  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  30.41 
 
 		 588 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.440319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  24.64 
 
 		 660 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  23.29 
 
 		 599 aa  44.3  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  21.52 
 
 		 728 aa  44.3  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  24.1 
 
 		 659 aa  43.9  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>