111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3084 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  100 
 
 
627 aa  1258    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  45.22 
 
 
602 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  44.54 
 
 
608 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  43.34 
 
 
619 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  43.34 
 
 
619 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  43.34 
 
 
619 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  41.96 
 
 
640 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  43.48 
 
 
602 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  36.31 
 
 
624 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  36.58 
 
 
603 aa  353  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  36.68 
 
 
605 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  29.5 
 
 
645 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  29.49 
 
 
686 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  27.69 
 
 
666 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  27.49 
 
 
641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  31.36 
 
 
626 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  30.23 
 
 
407 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.67 
 
 
588 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.66 
 
 
605 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  27.45 
 
 
617 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  27.22 
 
 
610 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  32.44 
 
 
614 aa  104  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  25.92 
 
 
614 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  25.92 
 
 
614 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  30.42 
 
 
620 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  28.96 
 
 
679 aa  88.6  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  22.12 
 
 
444 aa  88.6  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  24.91 
 
 
602 aa  80.9  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  25.56 
 
 
719 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  27.27 
 
 
583 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  28.1 
 
 
664 aa  67.8  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.21 
 
 
564 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  26.67 
 
 
585 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  27.98 
 
 
693 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.61 
 
 
585 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  27.4 
 
 
506 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  20.21 
 
 
390 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  23.93 
 
 
551 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  23.92 
 
 
743 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.32 
 
 
587 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  24.62 
 
 
546 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  22.57 
 
 
674 aa  59.3  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  24.54 
 
 
652 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  25.22 
 
 
652 aa  58.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  21.98 
 
 
728 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  22.55 
 
 
728 aa  58.5  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  21.55 
 
 
728 aa  58.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  24.64 
 
 
1249 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  25.73 
 
 
952 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  25.64 
 
 
741 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  21.36 
 
 
789 aa  56.2  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  27.6 
 
 
585 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  24.61 
 
 
653 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  25.12 
 
 
654 aa  55.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  23.61 
 
 
654 aa  54.7  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  30.32 
 
 
493 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  25.99 
 
 
648 aa  54.3  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  23.28 
 
 
599 aa  54.3  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  24.41 
 
 
712 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  24.41 
 
 
712 aa  53.9  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  26.73 
 
 
632 aa  53.9  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3242  hypothetical protein  29.73 
 
 
377 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.202403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  23.24 
 
 
660 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  22.73 
 
 
615 aa  52.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.98 
 
 
1228 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  22.04 
 
 
589 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  19.2 
 
 
1219 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  19.46 
 
 
741 aa  51.6  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  24.76 
 
 
649 aa  51.2  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  24.59 
 
 
659 aa  50.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  24.59 
 
 
659 aa  50.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  21.05 
 
 
1219 aa  50.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  25.87 
 
 
655 aa  50.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  24.57 
 
 
1164 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  22.84 
 
 
659 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  43.55 
 
 
496 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  21.59 
 
 
1146 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  21.59 
 
 
1146 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  40.32 
 
 
502 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  40.32 
 
 
502 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  18.62 
 
 
1219 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  18.62 
 
 
1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  18.62 
 
 
1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  18.62 
 
 
1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  18.62 
 
 
1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  40.32 
 
 
502 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  23.89 
 
 
693 aa  47.8  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  18.62 
 
 
1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  18.62 
 
 
1219 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  20.34 
 
 
1145 aa  47.8  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  18.89 
 
 
1219 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  18.62 
 
 
1219 aa  47.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  23.05 
 
 
660 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  45.16 
 
 
610 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  24.69 
 
 
655 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  24.14 
 
 
601 aa  47  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  24.27 
 
 
648 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  23.05 
 
 
660 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  24.69 
 
 
655 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  24.69 
 
 
655 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>