99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2547 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2547  dynamin  100 
 
 
551 aa  1124    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  35.52 
 
 
741 aa  319  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  34.71 
 
 
620 aa  90.9  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  29.5 
 
 
693 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  24.85 
 
 
952 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.82 
 
 
605 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  24.19 
 
 
588 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  28.31 
 
 
712 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  28.31 
 
 
712 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  29.06 
 
 
614 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  29.06 
 
 
614 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25.62 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  26.81 
 
 
789 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  29.22 
 
 
615 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.63 
 
 
583 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.37 
 
 
587 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  28.74 
 
 
719 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.51 
 
 
546 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  27.41 
 
 
599 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  28.73 
 
 
564 aa  63.9  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.27 
 
 
585 aa  63.9  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  27.91 
 
 
728 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  24.6 
 
 
741 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  27.91 
 
 
728 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  28.93 
 
 
390 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  29.07 
 
 
610 aa  62  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2958  GTPase  30.05 
 
 
768 aa  61.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  27.06 
 
 
1164 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  27.6 
 
 
632 aa  60.8  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  29.26 
 
 
693 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  22.58 
 
 
627 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  26.51 
 
 
728 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  27.1 
 
 
743 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  25.6 
 
 
1228 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  25.85 
 
 
692 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  27.51 
 
 
674 aa  59.3  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28.25 
 
 
614 aa  58.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  25.67 
 
 
407 aa  57.8  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.48 
 
 
548 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  28.23 
 
 
569 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  27.42 
 
 
569 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.94 
 
 
585 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  27.59 
 
 
589 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2227  hypothetical protein  23.27 
 
 
888 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  31.78 
 
 
603 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  26.01 
 
 
585 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  25.5 
 
 
601 aa  53.5  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  27.54 
 
 
524 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  24.16 
 
 
537 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  28.91 
 
 
605 aa  52.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.23 
 
 
1249 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  25.81 
 
 
602 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  24.31 
 
 
516 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  23.03 
 
 
679 aa  51.6  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0828  hypothetical protein  24.31 
 
 
516 aa  51.2  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000529126  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  24.02 
 
 
1219 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  24.8 
 
 
1219 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24.8 
 
 
1219 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.8 
 
 
1219 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.8 
 
 
1219 aa  50.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.8 
 
 
1219 aa  50.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  24.85 
 
 
605 aa  50.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.8 
 
 
1219 aa  50.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  24 
 
 
1219 aa  50.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  26.19 
 
 
1145 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  22 
 
 
666 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  24.52 
 
 
655 aa  50.4  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  30.32 
 
 
976 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.8 
 
 
1219 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  31.03 
 
 
496 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  24.8 
 
 
1219 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  27.19 
 
 
569 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4313  hypothetical protein  25.47 
 
 
797 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173972  normal  0.605686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24 
 
 
1219 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  26.88 
 
 
664 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  23.55 
 
 
1146 aa  47.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  23.55 
 
 
1146 aa  47.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  24.86 
 
 
608 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3865  hypothetical protein  25 
 
 
927 aa  47  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  35.59 
 
 
793 aa  47  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  24.43 
 
 
927 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1433  hypothetical protein  25 
 
 
927 aa  47  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.219985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  33.78 
 
 
814 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3518  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 
927 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  25.54 
 
 
692 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  29.25 
 
 
503 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  24.64 
 
 
686 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  34.62 
 
 
819 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  26.8 
 
 
569 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3896  hypothetical protein  23.86 
 
 
927 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  23.91 
 
 
648 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3609  hypothetical protein  23.86 
 
 
927 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3777  hypothetical protein  23.86 
 
 
927 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  23.37 
 
 
662 aa  45.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3242  hypothetical protein  24.86 
 
 
377 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.202403 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3506  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
927 aa  44.3  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0255227  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  26.12 
 
 
568 aa  43.9  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4146  hypothetical protein  27.66 
 
 
283 aa  43.5  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  24.8 
 
 
533 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>