55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3727 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  1007    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  42.72 
 
 		 536 aa  388  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  44.83 
 
 		 497 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  34.09 
 
 		 610 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  33.33 
 
 		 496 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  33.11 
 
 		 501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  33.48 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  31.13 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  30.06 
 
 		 533 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  27.93 
 
 		 524 aa  123  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  29.01 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  29.02 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  30.77 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  27.83 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  27.61 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  27.61 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  30.32 
 
 		 1164 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  27.57 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  30.94 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  25.6 
 
 		 674 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  37.86 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.99 
 
 		 601 aa  67  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  34.55 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  31.58 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  28.81 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.77 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.77 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  32.71 
 
 		 570 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  34.57 
 
 		 693 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  40.58 
 
 		 390 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  26.46 
 
 		 420 aa  51.6  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2958  GTPase  28.79 
 
 		 768 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  26.47 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  28.97 
 
 		 599 aa  50.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.03 
 
 		 587 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  35.09 
 
 		 603 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  28.89 
 
 		 679 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  25.69 
 
 		 610 aa  48.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  29.2 
 
 		 664 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  42.11 
 
 		 914 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.23 
 
 		 614 aa  47.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  27.78 
 
 		 569 aa  47  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  25.86 
 
 		 976 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4146  hypothetical protein  28.92 
 
 		 283 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2227  hypothetical protein  43.1 
 
 		 888 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  24.6 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  29.25 
 
 		 551 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  30.4 
 
 		 605 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  42 
 
 		 655 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.81 
 
 		 588 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  27.19 
 
 		 666 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4311  hypothetical protein  28.3 
 
 		 768 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  37.93 
 
 		 741 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  32.89 
 
 		 719 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  38.33 
 
 		 440 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>