17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  818    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  48.48 
 
 		 478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  37.21 
 
 		 496 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  35.98 
 
 		 501 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  34.56 
 
 		 501 aa  206  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  33.68 
 
 		 496 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  32.33 
 
 		 502 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  31.15 
 
 		 493 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  33.03 
 
 		 502 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  33.03 
 
 		 502 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  32.74 
 
 		 468 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  40.57 
 
 		 527 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  25.39 
 
 		 524 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  32.48 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  30.41 
 
 		 536 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  28.8 
 
 		 610 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  30.43 
 
 		 440 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>