52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5963 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1188    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  33.14 
 
 		 536 aa  177  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  34.09 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  34.78 
 
 		 497 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  34.08 
 
 		 501 aa  157  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  34.21 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  32.71 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  34.58 
 
 		 527 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  36.09 
 
 		 493 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  34.24 
 
 		 502 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  33.97 
 
 		 502 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  33.97 
 
 		 502 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  29.09 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  31.24 
 
 		 496 aa  113  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  32.48 
 
 		 468 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  24.14 
 
 		 533 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  30.17 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  37.84 
 
 		 1164 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  28.8 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  25.68 
 
 		 674 aa  60.5  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  24.67 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  33.6 
 
 		 587 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  39.5 
 
 		 569 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  32.48 
 
 		 626 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  31.71 
 
 		 601 aa  55.5  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  30.46 
 
 		 608 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  28.76 
 
 		 693 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  39.5 
 
 		 568 aa  54.7  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  29.55 
 
 		 569 aa  54.3  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  35.25 
 
 		 407 aa  54.3  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  29.79 
 
 		 602 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  31.16 
 
 		 614 aa  53.9  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  31.16 
 
 		 614 aa  53.9  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  29.32 
 
 		 569 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  29.51 
 
 		 585 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  30.94 
 
 		 610 aa  51.2  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  29.84 
 
 		 585 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  30.65 
 
 		 679 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.68 
 
 		 1249 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  29.89 
 
 		 605 aa  49.7  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  32.38 
 
 		 976 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  23.98 
 
 		 686 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  45.16 
 
 		 627 aa  47.4  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  27.48 
 
 		 569 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  27.86 
 
 		 537 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  31.54 
 
 		 605 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  28.26 
 
 		 641 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1145 aa  45.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  28.74 
 
 		 603 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2227  hypothetical protein  55.88 
 
 		 888 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4146  hypothetical protein  34.58 
 
 		 283 aa  44.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  29.06 
 
 		 605 aa  43.9  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>