46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1638 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  95.2 
 
 		 501 aa  941    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 501 aa  987    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  47.49 
 
 		 496 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  41.46 
 
 		 527 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  40.57 
 
 		 493 aa  286  7e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  41.27 
 
 		 468 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  40.33 
 
 		 502 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  40.33 
 
 		 502 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  40.33 
 
 		 502 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  38.7 
 
 		 496 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  38.26 
 
 		 478 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  35.98 
 
 		 420 aa  210  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  28.16 
 
 		 533 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  28.74 
 
 		 524 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  34.73 
 
 		 497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  33.48 
 
 		 503 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  35.42 
 
 		 536 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  34.21 
 
 		 610 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.7 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  24.23 
 
 		 610 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  31.33 
 
 		 693 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  30 
 
 		 674 aa  57  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.55 
 
 		 615 aa  56.6  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  32.61 
 
 		 679 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  29.32 
 
 		 605 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  27.22 
 
 		 620 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.81 
 
 		 601 aa  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  24.5 
 
 		 1164 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.85 
 
 		 599 aa  48.5  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  31.69 
 
 		 626 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  28.83 
 
 		 1228 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  24.64 
 
 		 588 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  26.25 
 
 		 614 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  26.25 
 
 		 614 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  23.29 
 
 		 666 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  29.63 
 
 		 585 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  38.36 
 
 		 914 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  51.16 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  34.51 
 
 		 608 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  30.19 
 
 		 603 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9372  predicted protein  31.55 
 
 		 504 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  45.76 
 
 		 490 aa  43.9  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  30.38 
 
 		 605 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  41.18 
 
 		 298 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25.94 
 
 		 686 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  37.17 
 
 		 407 aa  43.5  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>