83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1653 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 524 aa  1082    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  50.48 
 
 		 533 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  30.42 
 
 		 496 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  30.31 
 
 		 501 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  28.74 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  29.53 
 
 		 527 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  26.26 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  25.51 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  26.24 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  25.33 
 
 		 502 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  25.33 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  25.33 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  27.93 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  29.09 
 
 		 610 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  27.32 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  28.25 
 
 		 497 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  25.39 
 
 		 420 aa  90.9  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  24.27 
 
 		 478 aa  90.9  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  34.19 
 
 		 674 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  34.03 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  29.41 
 
 		 1164 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  37.98 
 
 		 610 aa  73.6  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  38.1 
 
 		 599 aa  70.5  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  36.36 
 
 		 601 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  33.83 
 
 		 569 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  33.08 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  27.55 
 
 		 608 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  36.7 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  31.3 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  32.52 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  32.52 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  25.82 
 
 		 585 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  31.58 
 
 		 569 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  27.1 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  29.91 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  31.71 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  28.97 
 
 		 569 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  29.6 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  28.95 
 
 		 712 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  28.95 
 
 		 712 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  24.24 
 
 		 548 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  31.03 
 
 		 603 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  25.74 
 
 		 583 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.97 
 
 		 614 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  31.62 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  27.54 
 
 		 602 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25.68 
 
 		 620 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  31.25 
 
 		 605 aa  54.7  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25.41 
 
 		 546 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  26.09 
 
 		 693 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  27.91 
 
 		 1228 aa  54.3  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  26.82 
 
 		 719 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  25.95 
 
 		 587 aa  54.3  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  24.82 
 
 		 585 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  29.94 
 
 		 692 aa  53.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  27.54 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  32.43 
 
 		 976 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  28.92 
 
 		 743 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  25.83 
 
 		 564 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  28.08 
 
 		 610 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  22.63 
 
 		 585 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  38.6 
 
 		 789 aa  48.9  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  29.37 
 
 		 1249 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  25.41 
 
 		 664 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  21.88 
 
 		 679 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  25.6 
 
 		 587 aa  47  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  26.62 
 
 		 655 aa  46.6  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  30.25 
 
 		 617 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  33.33 
 
 		 741 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  30.15 
 
 		 693 aa  47  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  34.55 
 
 		 728 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  34.55 
 
 		 728 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  34.55 
 
 		 728 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  27.36 
 
 		 632 aa  44.3  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  29 
 
 		 571 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  26.77 
 
 		 631 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  29.23 
 
 		 619 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  35.71 
 
 		 453 aa  43.9  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  31.18 
 
 		 788 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  29.23 
 
 		 619 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  29.23 
 
 		 619 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  25.93 
 
 		 952 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>