82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0403 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  100 
 
 		 693 aa  1378    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  34.43 
 
 		 692 aa  323  6e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  31.91 
 
 		 692 aa  294  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  34.48 
 
 		 741 aa  248  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  33.22 
 
 		 728 aa  243  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  31.08 
 
 		 728 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  31.24 
 
 		 728 aa  239  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  32.02 
 
 		 789 aa  239  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.81 
 
 		 605 aa  88.6  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  29.82 
 
 		 655 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25.54 
 
 		 620 aa  77.4  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.45 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  24.63 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  24.84 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  24.84 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  23.72 
 
 		 588 aa  73.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  31.1 
 
 		 605 aa  70.9  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  21.29 
 
 		 914 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  26.28 
 
 		 674 aa  68.2  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  26.79 
 
 		 952 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  22.94 
 
 		 679 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  24.78 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  23.74 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1219 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  23.87 
 
 		 1219 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1219 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25.63 
 
 		 548 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  21.88 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  23.23 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  27.05 
 
 		 601 aa  62  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1219 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.02 
 
 		 1228 aa  60.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1219 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  22.71 
 
 		 585 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  24.43 
 
 		 648 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  29.26 
 
 		 551 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  38.24 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  38.24 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  23.47 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  27.42 
 
 		 747 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  23.47 
 
 		 585 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.29 
 
 		 589 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  27.84 
 
 		 615 aa  55.8  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  24.53 
 
 		 712 aa  55.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  24.53 
 
 		 712 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  26.11 
 
 		 599 aa  55.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  22.87 
 
 		 564 aa  55.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.67 
 
 		 1249 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  30.11 
 
 		 390 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  28.18 
 
 		 610 aa  54.7  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  25.6 
 
 		 569 aa  55.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  24 
 
 		 602 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  25.24 
 
 		 669 aa  54.7  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  27.12 
 
 		 693 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  20.83 
 
 		 1219 aa  53.9  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  26.63 
 
 		 569 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  23.05 
 
 		 583 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  21.24 
 
 		 1164 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  22.87 
 
 		 1219 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  25.13 
 
 		 569 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  21.74 
 
 		 608 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  23.18 
 
 		 664 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  25.2 
 
 		 737 aa  47.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  28.66 
 
 		 719 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  25.73 
 
 		 602 aa  47.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  30.15 
 
 		 524 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1146 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  22.93 
 
 		 617 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1146 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  28.17 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  23.89 
 
 		 641 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  24.66 
 
 		 666 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  28.17 
 
 		 976 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  23.8 
 
 		 621 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  27.72 
 
 		 690 aa  45.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  24.04 
 
 		 627 aa  45.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  21.89 
 
 		 632 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  20.66 
 
 		 687 aa  44.3  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>