88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1546 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  96.98 
 
 
728 aa  1343    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  96.15 
 
 
728 aa  1330    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  100 
 
 
728 aa  1410    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  45.42 
 
 
741 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  34.05 
 
 
692 aa  269  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  30.29 
 
 
789 aa  253  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  31.68 
 
 
693 aa  246  8e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  28.82 
 
 
692 aa  228  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  24.93 
 
 
614 aa  93.2  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  24.93 
 
 
614 aa  93.2  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  30.91 
 
 
655 aa  89.4  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25.54 
 
 
620 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  25.78 
 
 
914 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26.45 
 
 
444 aa  81.3  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  25.49 
 
 
737 aa  80.5  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.18 
 
 
679 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  25.76 
 
 
648 aa  74.3  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  28.81 
 
 
1145 aa  72.4  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  23.57 
 
 
614 aa  71.6  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  22.69 
 
 
588 aa  71.2  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  24.71 
 
 
952 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  22.41 
 
 
1228 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  21.86 
 
 
585 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  28.64 
 
 
693 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  28.37 
 
 
1146 aa  68.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  28.37 
 
 
1146 aa  68.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  29.7 
 
 
664 aa  65.1  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  22.8 
 
 
741 aa  65.1  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.15 
 
 
546 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  21.3 
 
 
605 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  25 
 
 
1219 aa  61.6  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.64 
 
 
1249 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  25.28 
 
 
1219 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  25.41 
 
 
666 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  25.69 
 
 
587 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.42 
 
 
599 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  26.51 
 
 
551 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  25.77 
 
 
747 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.79 
 
 
548 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  24.79 
 
 
674 aa  58.9  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  28.83 
 
 
632 aa  58.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  24.81 
 
 
1219 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  26.29 
 
 
390 aa  57.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.44 
 
 
1219 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  21.05 
 
 
602 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  24.44 
 
 
1219 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  24.44 
 
 
1219 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  23.22 
 
 
1219 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.44 
 
 
1219 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.44 
 
 
1219 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  24.51 
 
 
615 aa  56.6  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.44 
 
 
1219 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  24.7 
 
 
583 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.44 
 
 
1219 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  21.11 
 
 
608 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  28.14 
 
 
712 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  21.86 
 
 
669 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  28.14 
 
 
712 aa  55.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  22.69 
 
 
690 aa  54.3  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  22.26 
 
 
407 aa  54.3  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  22.03 
 
 
605 aa  54.3  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  22.6 
 
 
659 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  21.55 
 
 
627 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3241  hypothetical protein  21.99 
 
 
701 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424081  normal  0.24585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  21.37 
 
 
603 aa  52  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  21.55 
 
 
764 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  22.22 
 
 
564 aa  51.6  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  30.53 
 
 
585 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  32.11 
 
 
569 aa  51.2  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  27.22 
 
 
601 aa  50.8  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  37.14 
 
 
793 aa  50.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  23.83 
 
 
523 aa  49.7  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  26.18 
 
 
719 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  26.09 
 
 
743 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  42.42 
 
 
570 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  21.31 
 
 
1164 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  39.29 
 
 
533 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  21.15 
 
 
578 aa  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  32.11 
 
 
569 aa  48.5  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  45.1 
 
 
976 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  23.99 
 
 
569 aa  47.8  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  23.49 
 
 
585 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  22.91 
 
 
686 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  27.23 
 
 
672 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  24.19 
 
 
605 aa  45.8  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  24.05 
 
 
587 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  34.55 
 
 
524 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  21.52 
 
 
624 aa  44.3  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>