57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5428 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1349    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  64.97 
 
 		 660 aa  862    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  55.75 
 
 		 655 aa  715    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  64.81 
 
 		 660 aa  860    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  60.53 
 
 		 658 aa  754    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  57.76 
 
 		 659 aa  733    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  65.52 
 
 		 653 aa  853    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  61.5 
 
 		 659 aa  776    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  48.58 
 
 		 675 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  46.09 
 
 		 709 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  41.71 
 
 		 651 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  40.65 
 
 		 672 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  40.16 
 
 		 662 aa  482  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  40.45 
 
 		 648 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  39.66 
 
 		 649 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  40.29 
 
 		 648 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  40.06 
 
 		 654 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  39.32 
 
 		 652 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  37.4 
 
 		 652 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  35.9 
 
 		 648 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  31.14 
 
 		 660 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  34.34 
 
 		 655 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  32.7 
 
 		 655 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  30.59 
 
 		 654 aa  293  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  29.98 
 
 		 659 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  29.98 
 
 		 659 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.52 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  24.28 
 
 		 614 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  24.28 
 
 		 614 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  26.63 
 
 		 605 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  22.76 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  20.93 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  23.03 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  29.32 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  29.71 
 
 		 585 aa  54.3  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  23.71 
 
 		 620 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  22.22 
 
 		 693 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  33.62 
 
 		 548 aa  50.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  28.39 
 
 		 546 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  29.89 
 
 		 632 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25.58 
 
 		 686 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  24.45 
 
 		 814 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.2 
 
 		 587 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.56 
 
 		 585 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  27.69 
 
 		 728 aa  47.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  23.11 
 
 		 719 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.37 
 
 		 583 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  27.23 
 
 		 728 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  27.55 
 
 		 640 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  25.54 
 
 		 624 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.32 
 
 		 655 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  27.69 
 
 		 728 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  22.69 
 
 		 659 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  29.79 
 
 		 407 aa  45.8  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.08 
 
 		 1249 aa  45.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  20.2 
 
 		 390 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  27.08 
 
 		 602 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>