34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3241 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3241  hypothetical protein  100 
 
 		 701 aa  1394    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424081  normal  0.24585 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  37.72 
 
 		 659 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  31.94 
 
 		 669 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  36.97 
 
 		 764 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  42.18 
 
 		 690 aa  207  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  29.15 
 
 		 655 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  25.9 
 
 		 789 aa  65.5  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  23.14 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  28.25 
 
 		 747 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  21.01 
 
 		 741 aa  57  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  21.32 
 
 		 728 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  20.87 
 
 		 728 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  21.32 
 
 		 728 aa  55.5  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  65.85 
 
 		 693 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  25.6 
 
 		 737 aa  52.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1925  hypothetical protein  22.89 
 
 		 788 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  hitchhiker  0.0041869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  25.6 
 
 		 460 aa  50.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  23.45 
 
 		 693 aa  49.3  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  27.94 
 
 		 444 aa  47.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  28.44 
 
 		 632 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  35.35 
 
 		 605 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  22.78 
 
 		 1228 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  31.03 
 
 		 583 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  25.97 
 
 		 659 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  25.97 
 
 		 659 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  30.65 
 
 		 641 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  40.32 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  40.32 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  36.28 
 
 		 614 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  34.78 
 
 		 548 aa  45.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  48.72 
 
 		 666 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  27.48 
 
 		 551 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  31.34 
 
 		 546 aa  44.3  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  24.5 
 
 		 648 aa  44.3  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>