23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4145 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  100 
 
 
690 aa  1390    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  37.88 
 
 
669 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  37.84 
 
 
764 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  38.15 
 
 
659 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3241  hypothetical protein  44.49 
 
 
701 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424081  normal  0.24585 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.63 
 
 
655 aa  91.3  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.4 
 
 
1249 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  22.33 
 
 
741 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  22.99 
 
 
728 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  24.82 
 
 
737 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  22.99 
 
 
728 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  25.1 
 
 
747 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  22.69 
 
 
728 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  22.13 
 
 
789 aa  52  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  45 
 
 
605 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  22.44 
 
 
692 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  32.41 
 
 
952 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  27.72 
 
 
693 aa  45.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  30.56 
 
 
693 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  52.5 
 
 
614 aa  44.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  52.5 
 
 
614 aa  44.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  25.94 
 
 
675 aa  44.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  27.61 
 
 
500 aa  43.9  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>