85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0437 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  100 
 
 
692 aa  1373    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  38.74 
 
 
692 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  36.51 
 
 
693 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  33.28 
 
 
728 aa  274  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  32.85 
 
 
728 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  31.5 
 
 
741 aa  261  4e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  32.22 
 
 
728 aa  259  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  29.36 
 
 
789 aa  219  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  24.01 
 
 
620 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  26.76 
 
 
614 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  26.76 
 
 
614 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  29.3 
 
 
655 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  27.66 
 
 
679 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  28.05 
 
 
664 aa  75.5  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  30.21 
 
 
605 aa  67.8  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  20.65 
 
 
914 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.27 
 
 
587 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  23.37 
 
 
693 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  23.47 
 
 
444 aa  65.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  24.52 
 
 
1228 aa  64.3  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  21.62 
 
 
588 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  24.47 
 
 
601 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.42 
 
 
1249 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.08 
 
 
605 aa  61.2  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  25.76 
 
 
583 aa  60.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  29.5 
 
 
743 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  25.54 
 
 
952 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  21.16 
 
 
614 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.36 
 
 
546 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  25.85 
 
 
551 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  26.06 
 
 
1219 aa  57.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  24.54 
 
 
599 aa  57.4  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25.26 
 
 
548 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  25.73 
 
 
1219 aa  57  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.23 
 
 
1219 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  29.38 
 
 
569 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  27.84 
 
 
569 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  25.25 
 
 
666 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  21.41 
 
 
585 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  27.68 
 
 
569 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  24.37 
 
 
674 aa  55.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  23.5 
 
 
1219 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  23.5 
 
 
1219 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  23.5 
 
 
1219 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  23.5 
 
 
1219 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  23.5 
 
 
1219 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  23.5 
 
 
1219 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  25.53 
 
 
1219 aa  55.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  25 
 
 
1219 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  25.37 
 
 
615 aa  55.1  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  23.5 
 
 
585 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  23.75 
 
 
610 aa  54.3  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  22.08 
 
 
407 aa  53.9  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  23.04 
 
 
632 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  22.88 
 
 
1145 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  23.87 
 
 
1146 aa  51.2  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  23.87 
 
 
1146 aa  51.2  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  22.87 
 
 
523 aa  50.8  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25.11 
 
 
686 aa  50.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  25.73 
 
 
648 aa  50.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  23.55 
 
 
564 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  21.25 
 
 
589 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  22.47 
 
 
602 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  22.03 
 
 
608 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  24.68 
 
 
741 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  23.28 
 
 
585 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  21.72 
 
 
1164 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  27.84 
 
 
673 aa  46.6  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  29.67 
 
 
662 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  29.67 
 
 
672 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  29.67 
 
 
648 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  30.08 
 
 
712 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  22.44 
 
 
690 aa  46.6  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  30.08 
 
 
712 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  29.67 
 
 
648 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  29.06 
 
 
533 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  25.62 
 
 
747 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  29.67 
 
 
651 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  30.11 
 
 
658 aa  44.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  23.73 
 
 
619 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  22.6 
 
 
605 aa  43.9  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  26.29 
 
 
719 aa  44.3  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  30.92 
 
 
460 aa  44.3  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  23.73 
 
 
619 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  23.73 
 
 
619 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>