46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1406 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  100 
 
 		 914 aa  1868    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  27.25 
 
 		 741 aa  107  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  25.78 
 
 		 728 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  24.15 
 
 		 728 aa  85.1  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  24.15 
 
 		 728 aa  85.1  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  29.79 
 
 		 675 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  23.26 
 
 		 789 aa  78.2  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  28.83 
 
 		 689 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  29.19 
 
 		 670 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  30.6 
 
 		 686 aa  71.6  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  21.29 
 
 		 693 aa  70.5  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  30.07 
 
 		 694 aa  68.6  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  20.65 
 
 		 692 aa  65.9  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  24.43 
 
 		 655 aa  65.9  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  27.45 
 
 		 703 aa  65.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1219 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1219 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1219 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25 
 
 		 1249 aa  65.1  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  24.68 
 
 		 1219 aa  65.1  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1219 aa  64.7  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  25 
 
 		 1219 aa  64.3  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  25 
 
 		 1219 aa  64.3  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  25 
 
 		 1219 aa  64.3  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  25 
 
 		 1219 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  25 
 
 		 1219 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  23.71 
 
 		 1219 aa  62  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  23.1 
 
 		 693 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  23.72 
 
 		 737 aa  59.3  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  26.79 
 
 		 648 aa  55.5  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  27.62 
 
 		 692 aa  51.6  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.79 
 
 		 1228 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  22.06 
 
 		 7659 aa  49.3  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  24.11 
 
 		 620 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  23.14 
 
 		 747 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  41.18 
 
 		 615 aa  48.1  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1145 aa  47.8  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  42.11 
 
 		 503 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  40 
 
 		 546 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  27.27 
 
 		 674 aa  46.6  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  34.18 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  24.38 
 
 		 666 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  20.8 
 
 		 1146 aa  45.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  20.8 
 
 		 1146 aa  45.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  22.92 
 
 		 390 aa  44.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  38.36 
 
 		 501 aa  44.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>