130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2545 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2545  dynamin  100 
 
 
390 aa  789    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  64.84 
 
 
719 aa  431  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  28.11 
 
 
693 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  26.09 
 
 
952 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  28.36 
 
 
588 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  27.88 
 
 
605 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.48 
 
 
614 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.48 
 
 
614 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  25.48 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  27.78 
 
 
620 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  29.38 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  28.38 
 
 
674 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  23.49 
 
 
614 aa  74.7  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  25.81 
 
 
605 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  28.99 
 
 
664 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  25.27 
 
 
603 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25.84 
 
 
546 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  25.08 
 
 
551 aa  69.7  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  27.27 
 
 
602 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.79 
 
 
679 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  30 
 
 
789 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  28.12 
 
 
615 aa  67  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  28.16 
 
 
712 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  28.16 
 
 
712 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  22.74 
 
 
583 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  27.95 
 
 
741 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  23.28 
 
 
587 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  26.24 
 
 
666 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  30.3 
 
 
599 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  23.78 
 
 
602 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  23.88 
 
 
608 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  31.06 
 
 
610 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  26.51 
 
 
570 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  23.24 
 
 
548 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  30.91 
 
 
601 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  23.46 
 
 
1164 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  27.14 
 
 
741 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  22.98 
 
 
585 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  24.43 
 
 
728 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  24.76 
 
 
728 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  19.81 
 
 
627 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  31.06 
 
 
605 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  24.1 
 
 
728 aa  56.6  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  26.29 
 
 
1228 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  23.56 
 
 
564 aa  56.2  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  31.62 
 
 
524 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  30.11 
 
 
693 aa  55.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  41.18 
 
 
503 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  27.92 
 
 
569 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  25.12 
 
 
659 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  25.12 
 
 
659 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  26.32 
 
 
568 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  25.66 
 
 
569 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  21.64 
 
 
675 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  26.14 
 
 
686 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  27.92 
 
 
569 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  25.41 
 
 
585 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  22.71 
 
 
654 aa  53.5  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  21.84 
 
 
537 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3518  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 
927 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  22.22 
 
 
1145 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  22.17 
 
 
672 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  24.4 
 
 
496 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  24.14 
 
 
927 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3865  hypothetical protein  23.3 
 
 
927 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1433  hypothetical protein  23.3 
 
 
927 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.219985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  42.86 
 
 
793 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  24.68 
 
 
569 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3506  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
927 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0255227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  22.34 
 
 
649 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.58 
 
 
589 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  29.49 
 
 
655 aa  51.6  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  22.42 
 
 
1219 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3609  hypothetical protein  23.65 
 
 
927 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3896  hypothetical protein  23.65 
 
 
927 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3777  hypothetical protein  23.65 
 
 
927 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3536  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 
927 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  27.32 
 
 
743 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3798  hypothetical protein  21.84 
 
 
927 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.245299  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  29.9 
 
 
493 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  21.93 
 
 
660 aa  49.7  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  21.93 
 
 
660 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  22.98 
 
 
654 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  32.43 
 
 
468 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  30.77 
 
 
587 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.25 
 
 
1219 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06897  transmembrane GTPase Fzo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13392)  27.32 
 
 
935 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  26.04 
 
 
619 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  33.78 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  26.04 
 
 
619 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  33.78 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  32.43 
 
 
496 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  26.04 
 
 
619 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  33.78 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  24.84 
 
 
585 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  28.18 
 
 
737 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  22.47 
 
 
1219 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  22.88 
 
 
1219 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  21.36 
 
 
652 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  21.03 
 
 
653 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>