60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3605 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  64.09 
 
 		 658 aa  803    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  100 
 
 		 653 aa  1315    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  75.08 
 
 		 660 aa  991    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  58.6 
 
 		 655 aa  764    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  75.23 
 
 		 660 aa  994    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  65.52 
 
 		 672 aa  853    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  65.16 
 
 		 659 aa  839    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  63.11 
 
 		 659 aa  811    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  46.35 
 
 		 675 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  45.15 
 
 		 709 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  41.22 
 
 		 651 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  40.93 
 
 		 672 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  39.03 
 
 		 648 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  39.81 
 
 		 662 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  39.03 
 
 		 648 aa  465  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  38.61 
 
 		 652 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  40.6 
 
 		 654 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  39.77 
 
 		 649 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  39.84 
 
 		 652 aa  445  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  35.35 
 
 		 648 aa  360  6e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  43.46 
 
 		 655 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  43.19 
 
 		 655 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  31.57 
 
 		 660 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  31.41 
 
 		 654 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  29.94 
 
 		 659 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  29.94 
 
 		 659 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  26.34 
 
 		 614 aa  84  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  22.22 
 
 		 588 aa  74.7  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  26.28 
 
 		 605 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  28.51 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  28.02 
 
 		 666 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  20.44 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  25.13 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  23.85 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  23.85 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  23.33 
 
 		 693 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  26.76 
 
 		 814 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  33.87 
 
 		 548 aa  52  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.54 
 
 		 655 aa  51.2  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  21.6 
 
 		 719 aa  50.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  32.64 
 
 		 583 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  22.89 
 
 		 952 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2971  hypothetical protein  25.48 
 
 		 788 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25.77 
 
 		 686 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.51 
 
 		 546 aa  48.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  24.62 
 
 		 585 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  41.67 
 
 		 640 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  36.05 
 
 		 602 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  21.03 
 
 		 390 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  27.19 
 
 		 589 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  21.69 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.27 
 
 		 585 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  32.23 
 
 		 564 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  24.46 
 
 		 585 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  25.45 
 
 		 819 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  30.83 
 
 		 632 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  28.49 
 
 		 602 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  25.45 
 
 		 605 aa  44.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  24.39 
 
 		 627 aa  44.3  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  30.34 
 
 		 407 aa  44.3  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>